Protein–RNA interactions for Protein: P35716

SOX11, Transcription factor SOX-11, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX11P35716 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX11P35716 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX11P35716 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX11P35716 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX11P35716 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX11P35716 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX11P35716 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX11P35716 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX11P35716 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX11P35716 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX11P35716 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX11P35716 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX11P35716 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX11P35716 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX11P35716 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX11P35716 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX11P35716 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX11P35716 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX11P35716 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX11P35716 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX11P35716 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX11P35716 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SOX11P35716 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SOX11P35716 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOX11P35716 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOX11P35716 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SOX11P35716 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SOX11P35716 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOX11P35716 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOX11P35716 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOX11P35716 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOX11P35716 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOX11P35716 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOX11P35716 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOX11P35716 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOX11P35716 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOX11P35716 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOX11P35716 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOX11P35716 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SOX11P35716 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOX11P35716 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOX11P35716 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOX11P35716 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX11P35716 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX11P35716 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX11P35716 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX11P35716 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX11P35716 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX11P35716 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX11P35716 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX11P35716 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX11P35716 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX11P35716 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX11P35716 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX11P35716 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX11P35716 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOX11P35716 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOX11P35716 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOX11P35716 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SOX11P35716 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOX11P35716 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOX11P35716 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOX11P35716 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOX11P35716 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX11P35716 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX11P35716 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX11P35716 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX11P35716 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX11P35716 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX11P35716 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX11P35716 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX11P35716 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX11P35716 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX11P35716 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX11P35716 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX11P35716 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX11P35716 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX11P35716 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX11P35716 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX11P35716 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX11P35716 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX11P35716 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX11P35716 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX11P35716 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX11P35716 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX11P35716 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX11P35716 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOX11P35716 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOX11P35716 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SOX11P35716 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOX11P35716 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOX11P35716 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOX11P35716 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOX11P35716 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SOX11P35716 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SOX11P35716 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SOX11P35716 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX11P35716 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX11P35716 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX11P35716 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms