Protein–RNA interactions for Protein: P32456

GBP2, Guanylate-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP2P32456 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GBP2P32456 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GBP2P32456 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GBP2P32456 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GBP2P32456 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GBP2P32456 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GBP2P32456 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GBP2P32456 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GBP2P32456 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GBP2P32456 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GBP2P32456 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GBP2P32456 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GBP2P32456 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GBP2P32456 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GBP2P32456 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GBP2P32456 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GBP2P32456 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GBP2P32456 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GBP2P32456 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GBP2P32456 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GBP2P32456 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GBP2P32456 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GBP2P32456 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GBP2P32456 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GBP2P32456 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GBP2P32456 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GBP2P32456 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GBP2P32456 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GBP2P32456 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GBP2P32456 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GBP2P32456 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GBP2P32456 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GBP2P32456 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GBP2P32456 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GBP2P32456 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GBP2P32456 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GBP2P32456 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GBP2P32456 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GBP2P32456 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GBP2P32456 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GBP2P32456 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GBP2P32456 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GBP2P32456 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GBP2P32456 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GBP2P32456 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GBP2P32456 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GBP2P32456 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GBP2P32456 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GBP2P32456 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GBP2P32456 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GBP2P32456 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GBP2P32456 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GBP2P32456 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GBP2P32456 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GBP2P32456 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GBP2P32456 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GBP2P32456 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GBP2P32456 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GBP2P32456 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GBP2P32456 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GBP2P32456 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GBP2P32456 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GBP2P32456 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GBP2P32456 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
GBP2P32456 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GBP2P32456 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GBP2P32456 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GBP2P32456 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GBP2P32456 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GBP2P32456 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GBP2P32456 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GBP2P32456 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GBP2P32456 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GBP2P32456 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GBP2P32456 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GBP2P32456 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GBP2P32456 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GBP2P32456 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GBP2P32456 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GBP2P32456 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GBP2P32456 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GBP2P32456 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GBP2P32456 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GBP2P32456 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GBP2P32456 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GBP2P32456 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GBP2P32456 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GBP2P32456 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GBP2P32456 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GBP2P32456 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GBP2P32456 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GBP2P32456 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GBP2P32456 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GBP2P32456 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GBP2P32456 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GBP2P32456 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GBP2P32456 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GBP2P32456 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GBP2P32456 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GBP2P32456 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms