Protein–RNA interactions for Protein: P27448

MARK3, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK3P27448 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
MARK3P27448 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MARK3P27448 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MARK3P27448 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MARK3P27448 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MARK3P27448 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MARK3P27448 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MARK3P27448 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MARK3P27448 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MARK3P27448 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
MARK3P27448 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MARK3P27448 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MARK3P27448 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MARK3P27448 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MARK3P27448 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MARK3P27448 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
MARK3P27448 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MARK3P27448 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MARK3P27448 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MARK3P27448 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MARK3P27448 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
MARK3P27448 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MARK3P27448 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
MARK3P27448 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MARK3P27448 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
MARK3P27448 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MARK3P27448 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MARK3P27448 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MARK3P27448 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MARK3P27448 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MARK3P27448 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MARK3P27448 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MARK3P27448 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MARK3P27448 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
MARK3P27448 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
MARK3P27448 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MARK3P27448 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MARK3P27448 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MARK3P27448 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MARK3P27448 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MARK3P27448 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MARK3P27448 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
MARK3P27448 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MARK3P27448 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MARK3P27448 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MARK3P27448 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MARK3P27448 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MARK3P27448 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MARK3P27448 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MARK3P27448 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MARK3P27448 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MARK3P27448 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MARK3P27448 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MARK3P27448 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MARK3P27448 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MARK3P27448 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MARK3P27448 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MARK3P27448 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MARK3P27448 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MARK3P27448 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MARK3P27448 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MARK3P27448 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MARK3P27448 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MARK3P27448 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
MARK3P27448 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MARK3P27448 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MARK3P27448 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MARK3P27448 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MARK3P27448 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MARK3P27448 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MARK3P27448 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MARK3P27448 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MARK3P27448 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MARK3P27448 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MARK3P27448 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MARK3P27448 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
MARK3P27448 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MARK3P27448 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MARK3P27448 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MARK3P27448 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MARK3P27448 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MARK3P27448 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MARK3P27448 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MARK3P27448 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MARK3P27448 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MARK3P27448 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
MARK3P27448 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MARK3P27448 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MARK3P27448 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MARK3P27448 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MARK3P27448 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MARK3P27448 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MARK3P27448 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
MARK3P27448 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MARK3P27448 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MARK3P27448 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MARK3P27448 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MARK3P27448 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MARK3P27448 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MARK3P27448 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms