Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPN1P18031 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPN1P18031 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPN1P18031 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPN1P18031 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPN1P18031 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPN1P18031 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPN1P18031 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPN1P18031 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPN1P18031 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPN1P18031 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPN1P18031 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPN1P18031 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPN1P18031 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPN1P18031 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPN1P18031 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPN1P18031 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPN1P18031 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPN1P18031 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPN1P18031 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPN1P18031 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPN1P18031 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPN1P18031 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPN1P18031 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPN1P18031 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPN1P18031 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPN1P18031 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPN1P18031 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPN1P18031 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPN1P18031 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPN1P18031 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPN1P18031 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPN1P18031 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPN1P18031 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPN1P18031 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPN1P18031 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPN1P18031 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPN1P18031 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPN1P18031 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPN1P18031 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPN1P18031 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPN1P18031 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPN1P18031 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPN1P18031 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPN1P18031 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPN1P18031 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPN1P18031 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPN1P18031 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPN1P18031 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPN1P18031 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPN1P18031 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPN1P18031 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN1P18031 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN1P18031 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN1P18031 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN1P18031 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN1P18031 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN1P18031 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN1P18031 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN1P18031 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN1P18031 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN1P18031 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPN1P18031 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPN1P18031 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPN1P18031 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPN1P18031 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPN1P18031 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPN1P18031 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPN1P18031 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPN1P18031 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPN1P18031 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPN1P18031 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPN1P18031 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPN1P18031 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPN1P18031 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPN1P18031 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPN1P18031 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPN1P18031 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPN1P18031 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPN1P18031 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPN1P18031 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPN1P18031 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPN1P18031 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPN1P18031 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPN1P18031 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPN1P18031 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPN1P18031 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPN1P18031 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPN1P18031 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPN1P18031 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPN1P18031 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPN1P18031 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPN1P18031 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPN1P18031 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPN1P18031 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPN1P18031 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPN1P18031 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPN1P18031 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPN1P18031 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPN1P18031 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms