Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNRPBP14678 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNRPBP14678 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNRPBP14678 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNRPBP14678 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNRPBP14678 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNRPBP14678 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
SNRPBP14678 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SNRPBP14678 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SNRPBP14678 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SNRPBP14678 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SNRPBP14678 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNRPBP14678 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNRPBP14678 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNRPBP14678 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNRPBP14678 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNRPBP14678 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNRPBP14678 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SNRPBP14678 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SNRPBP14678 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNRPBP14678 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNRPBP14678 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNRPBP14678 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNRPBP14678 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNRPBP14678 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNRPBP14678 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNRPBP14678 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNRPBP14678 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNRPBP14678 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNRPBP14678 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNRPBP14678 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNRPBP14678 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNRPBP14678 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNRPBP14678 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNRPBP14678 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNRPBP14678 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNRPBP14678 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SNRPBP14678 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNRPBP14678 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNRPBP14678 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNRPBP14678 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNRPBP14678 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNRPBP14678 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNRPBP14678 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNRPBP14678 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNRPBP14678 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNRPBP14678 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNRPBP14678 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SNRPBP14678 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNRPBP14678 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNRPBP14678 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNRPBP14678 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNRPBP14678 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNRPBP14678 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SNRPBP14678 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNRPBP14678 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNRPBP14678 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNRPBP14678 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNRPBP14678 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNRPBP14678 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNRPBP14678 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNRPBP14678 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNRPBP14678 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNRPBP14678 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNRPBP14678 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNRPBP14678 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNRPBP14678 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNRPBP14678 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNRPBP14678 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNRPBP14678 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNRPBP14678 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNRPBP14678 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SNRPBP14678 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNRPBP14678 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNRPBP14678 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNRPBP14678 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNRPBP14678 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SNRPBP14678 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNRPBP14678 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNRPBP14678 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNRPBP14678 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNRPBP14678 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNRPBP14678 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNRPBP14678 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNRPBP14678 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNRPBP14678 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNRPBP14678 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNRPBP14678 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNRPBP14678 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNRPBP14678 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SNRPBP14678 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNRPBP14678 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNRPBP14678 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNRPBP14678 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNRPBP14678 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNRPBP14678 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNRPBP14678 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNRPBP14678 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNRPBP14678 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNRPBP14678 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms