Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-EP13747 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HLA-EP13747 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HLA-EP13747 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HLA-EP13747 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HLA-EP13747 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HLA-EP13747 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HLA-EP13747 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HLA-EP13747 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HLA-EP13747 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HLA-EP13747 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HLA-EP13747 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HLA-EP13747 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HLA-EP13747 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HLA-EP13747 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HLA-EP13747 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HLA-EP13747 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HLA-EP13747 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HLA-EP13747 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HLA-EP13747 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HLA-EP13747 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HLA-EP13747 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HLA-EP13747 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HLA-EP13747 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HLA-EP13747 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HLA-EP13747 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HLA-EP13747 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HLA-EP13747 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HLA-EP13747 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HLA-EP13747 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HLA-EP13747 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HLA-EP13747 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HLA-EP13747 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HLA-EP13747 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HLA-EP13747 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HLA-EP13747 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HLA-EP13747 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HLA-EP13747 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HLA-EP13747 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HLA-EP13747 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HLA-EP13747 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HLA-EP13747 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HLA-EP13747 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HLA-EP13747 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HLA-EP13747 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HLA-EP13747 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HLA-EP13747 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HLA-EP13747 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HLA-EP13747 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HLA-EP13747 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HLA-EP13747 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HLA-EP13747 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HLA-EP13747 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HLA-EP13747 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HLA-EP13747 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HLA-EP13747 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HLA-EP13747 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HLA-EP13747 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HLA-EP13747 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HLA-EP13747 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HLA-EP13747 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HLA-EP13747 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HLA-EP13747 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HLA-EP13747 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HLA-EP13747 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HLA-EP13747 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HLA-EP13747 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HLA-EP13747 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HLA-EP13747 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HLA-EP13747 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HLA-EP13747 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HLA-EP13747 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HLA-EP13747 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HLA-EP13747 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HLA-EP13747 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HLA-EP13747 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HLA-EP13747 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HLA-EP13747 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HLA-EP13747 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HLA-EP13747 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HLA-EP13747 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HLA-EP13747 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HLA-EP13747 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HLA-EP13747 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HLA-EP13747 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HLA-EP13747 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HLA-EP13747 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HLA-EP13747 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HLA-EP13747 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HLA-EP13747 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HLA-EP13747 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HLA-EP13747 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HLA-EP13747 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.02■■□□□ 1.43
HLA-EP13747 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HLA-EP13747 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HLA-EP13747 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HLA-EP13747 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HLA-EP13747 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HLA-EP13747 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HLA-EP13747 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms