Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGAMP11215 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGAMP11215 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGAMP11215 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGAMP11215 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGAMP11215 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGAMP11215 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGAMP11215 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGAMP11215 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGAMP11215 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGAMP11215 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGAMP11215 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGAMP11215 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGAMP11215 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGAMP11215 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGAMP11215 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGAMP11215 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGAMP11215 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGAMP11215 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGAMP11215 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGAMP11215 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGAMP11215 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGAMP11215 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGAMP11215 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGAMP11215 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGAMP11215 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGAMP11215 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGAMP11215 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGAMP11215 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGAMP11215 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGAMP11215 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGAMP11215 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGAMP11215 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGAMP11215 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGAMP11215 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGAMP11215 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGAMP11215 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGAMP11215 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGAMP11215 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGAMP11215 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGAMP11215 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGAMP11215 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGAMP11215 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGAMP11215 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGAMP11215 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGAMP11215 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGAMP11215 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGAMP11215 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGAMP11215 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGAMP11215 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGAMP11215 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGAMP11215 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGAMP11215 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGAMP11215 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGAMP11215 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGAMP11215 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGAMP11215 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGAMP11215 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGAMP11215 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGAMP11215 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGAMP11215 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGAMP11215 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGAMP11215 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGAMP11215 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGAMP11215 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGAMP11215 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGAMP11215 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGAMP11215 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGAMP11215 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGAMP11215 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGAMP11215 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGAMP11215 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGAMP11215 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGAMP11215 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGAMP11215 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGAMP11215 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGAMP11215 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGAMP11215 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGAMP11215 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGAMP11215 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGAMP11215 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGAMP11215 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGAMP11215 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGAMP11215 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGAMP11215 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGAMP11215 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGAMP11215 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGAMP11215 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGAMP11215 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGAMP11215 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGAMP11215 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGAMP11215 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGAMP11215 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGAMP11215 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGAMP11215 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGAMP11215 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGAMP11215 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGAMP11215 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGAMP11215 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGAMP11215 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms