Protein–RNA interactions for Protein: P08134

RHOC, Rho-related GTP-binding protein RhoC, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOCP08134 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHOCP08134 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHOCP08134 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RHOCP08134 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHOCP08134 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHOCP08134 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHOCP08134 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHOCP08134 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHOCP08134 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHOCP08134 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHOCP08134 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RHOCP08134 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RHOCP08134 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RHOCP08134 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHOCP08134 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHOCP08134 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHOCP08134 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHOCP08134 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHOCP08134 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHOCP08134 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RHOCP08134 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHOCP08134 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHOCP08134 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHOCP08134 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHOCP08134 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHOCP08134 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHOCP08134 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHOCP08134 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHOCP08134 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHOCP08134 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHOCP08134 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHOCP08134 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHOCP08134 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RHOCP08134 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RHOCP08134 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RHOCP08134 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RHOCP08134 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RHOCP08134 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RHOCP08134 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RHOCP08134 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RHOCP08134 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RHOCP08134 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHOCP08134 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHOCP08134 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHOCP08134 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHOCP08134 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHOCP08134 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHOCP08134 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHOCP08134 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHOCP08134 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHOCP08134 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHOCP08134 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHOCP08134 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHOCP08134 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHOCP08134 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHOCP08134 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHOCP08134 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHOCP08134 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHOCP08134 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHOCP08134 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHOCP08134 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHOCP08134 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RHOCP08134 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHOCP08134 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHOCP08134 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHOCP08134 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHOCP08134 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RHOCP08134 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHOCP08134 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHOCP08134 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHOCP08134 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHOCP08134 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOCP08134 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOCP08134 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOCP08134 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOCP08134 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHOCP08134 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHOCP08134 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RHOCP08134 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHOCP08134 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHOCP08134 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOCP08134 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOCP08134 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOCP08134 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOCP08134 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOCP08134 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOCP08134 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOCP08134 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOCP08134 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHOCP08134 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHOCP08134 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHOCP08134 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHOCP08134 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHOCP08134 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHOCP08134 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOCP08134 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOCP08134 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOCP08134 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOCP08134 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOCP08134 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms