Protein–RNA interactions for Protein: P02545

LMNA, Prelamin-A/C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNAP02545 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LMNAP02545 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMNAP02545 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMNAP02545 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LMNAP02545 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMNAP02545 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMNAP02545 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMNAP02545 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMNAP02545 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMNAP02545 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMNAP02545 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMNAP02545 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMNAP02545 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMNAP02545 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMNAP02545 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMNAP02545 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMNAP02545 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMNAP02545 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMNAP02545 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMNAP02545 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMNAP02545 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMNAP02545 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMNAP02545 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMNAP02545 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMNAP02545 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMNAP02545 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMNAP02545 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMNAP02545 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMNAP02545 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMNAP02545 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMNAP02545 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMNAP02545 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMNAP02545 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMNAP02545 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LMNAP02545 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMNAP02545 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMNAP02545 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMNAP02545 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMNAP02545 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMNAP02545 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMNAP02545 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LMNAP02545 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LMNAP02545 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMNAP02545 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMNAP02545 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMNAP02545 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMNAP02545 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMNAP02545 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMNAP02545 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMNAP02545 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMNAP02545 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMNAP02545 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMNAP02545 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMNAP02545 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMNAP02545 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LMNAP02545 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LMNAP02545 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMNAP02545 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMNAP02545 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMNAP02545 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMNAP02545 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMNAP02545 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMNAP02545 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMNAP02545 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMNAP02545 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMNAP02545 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMNAP02545 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMNAP02545 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMNAP02545 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMNAP02545 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMNAP02545 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMNAP02545 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMNAP02545 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMNAP02545 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMNAP02545 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMNAP02545 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMNAP02545 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMNAP02545 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMNAP02545 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMNAP02545 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMNAP02545 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMNAP02545 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LMNAP02545 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMNAP02545 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMNAP02545 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LMNAP02545 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMNAP02545 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMNAP02545 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMNAP02545 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMNAP02545 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMNAP02545 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMNAP02545 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMNAP02545 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LMNAP02545 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMNAP02545 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMNAP02545 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMNAP02545 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMNAP02545 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMNAP02545 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMNAP02545 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms