Protein–RNA interactions for Protein: O75390

CS, Citrate synthase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSO75390 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSO75390 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSO75390 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSO75390 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSO75390 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSO75390 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSO75390 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSO75390 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSO75390 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSO75390 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSO75390 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSO75390 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSO75390 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSO75390 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CSO75390 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CSO75390 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CSO75390 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSO75390 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSO75390 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSO75390 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSO75390 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSO75390 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSO75390 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CSO75390 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSO75390 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSO75390 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSO75390 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CSO75390 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSO75390 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSO75390 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSO75390 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSO75390 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSO75390 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSO75390 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSO75390 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSO75390 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSO75390 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSO75390 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSO75390 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSO75390 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSO75390 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSO75390 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSO75390 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSO75390 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CSO75390 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSO75390 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSO75390 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSO75390 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSO75390 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSO75390 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSO75390 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSO75390 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSO75390 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSO75390 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSO75390 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSO75390 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSO75390 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSO75390 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSO75390 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSO75390 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSO75390 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSO75390 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSO75390 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSO75390 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSO75390 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSO75390 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSO75390 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSO75390 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSO75390 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSO75390 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CSO75390 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSO75390 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CSO75390 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CSO75390 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSO75390 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSO75390 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSO75390 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSO75390 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSO75390 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSO75390 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSO75390 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSO75390 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSO75390 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSO75390 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSO75390 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSO75390 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSO75390 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSO75390 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSO75390 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSO75390 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CSO75390 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSO75390 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CSO75390 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSO75390 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSO75390 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CSO75390 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSO75390 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSO75390 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSO75390 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSO75390 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.2 ms