Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIN3BO75182 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SIN3BO75182 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIN3BO75182 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIN3BO75182 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIN3BO75182 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIN3BO75182 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIN3BO75182 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIN3BO75182 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIN3BO75182 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIN3BO75182 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIN3BO75182 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIN3BO75182 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIN3BO75182 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIN3BO75182 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIN3BO75182 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIN3BO75182 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SIN3BO75182 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIN3BO75182 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIN3BO75182 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIN3BO75182 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIN3BO75182 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIN3BO75182 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIN3BO75182 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIN3BO75182 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIN3BO75182 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIN3BO75182 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIN3BO75182 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIN3BO75182 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIN3BO75182 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIN3BO75182 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIN3BO75182 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SIN3BO75182 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIN3BO75182 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SIN3BO75182 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIN3BO75182 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIN3BO75182 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIN3BO75182 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIN3BO75182 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIN3BO75182 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SIN3BO75182 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIN3BO75182 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIN3BO75182 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIN3BO75182 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIN3BO75182 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIN3BO75182 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIN3BO75182 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIN3BO75182 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIN3BO75182 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SIN3BO75182 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIN3BO75182 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SIN3BO75182 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIN3BO75182 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SIN3BO75182 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIN3BO75182 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIN3BO75182 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIN3BO75182 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIN3BO75182 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIN3BO75182 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIN3BO75182 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SIN3BO75182 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIN3BO75182 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIN3BO75182 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIN3BO75182 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIN3BO75182 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIN3BO75182 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIN3BO75182 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIN3BO75182 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIN3BO75182 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIN3BO75182 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIN3BO75182 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIN3BO75182 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIN3BO75182 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIN3BO75182 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SIN3BO75182 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SIN3BO75182 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SIN3BO75182 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIN3BO75182 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIN3BO75182 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIN3BO75182 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIN3BO75182 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIN3BO75182 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIN3BO75182 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIN3BO75182 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SIN3BO75182 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIN3BO75182 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIN3BO75182 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIN3BO75182 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIN3BO75182 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIN3BO75182 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIN3BO75182 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIN3BO75182 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIN3BO75182 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIN3BO75182 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIN3BO75182 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIN3BO75182 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIN3BO75182 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIN3BO75182 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIN3BO75182 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIN3BO75182 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms