Protein–RNA interactions for Protein: O60216

RAD21, Double-strand-break repair protein rad21 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD21O60216 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAD21O60216 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAD21O60216 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAD21O60216 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAD21O60216 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAD21O60216 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAD21O60216 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAD21O60216 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAD21O60216 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAD21O60216 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAD21O60216 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAD21O60216 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAD21O60216 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAD21O60216 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAD21O60216 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
RAD21O60216 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAD21O60216 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAD21O60216 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAD21O60216 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
RAD21O60216 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
RAD21O60216 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAD21O60216 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAD21O60216 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAD21O60216 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAD21O60216 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAD21O60216 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
RAD21O60216 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAD21O60216 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RAD21O60216 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RAD21O60216 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RAD21O60216 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RAD21O60216 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RAD21O60216 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAD21O60216 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
RAD21O60216 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
RAD21O60216 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAD21O60216 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAD21O60216 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RAD21O60216 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RAD21O60216 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RAD21O60216 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
RAD21O60216 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RAD21O60216 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RAD21O60216 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
RAD21O60216 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RAD21O60216 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RAD21O60216 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RAD21O60216 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RAD21O60216 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RAD21O60216 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RAD21O60216 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RAD21O60216 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RAD21O60216 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RAD21O60216 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RAD21O60216 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RAD21O60216 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RAD21O60216 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RAD21O60216 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RAD21O60216 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAD21O60216 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAD21O60216 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAD21O60216 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAD21O60216 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAD21O60216 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAD21O60216 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAD21O60216 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAD21O60216 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAD21O60216 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAD21O60216 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAD21O60216 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAD21O60216 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAD21O60216 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAD21O60216 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAD21O60216 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAD21O60216 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAD21O60216 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAD21O60216 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
RAD21O60216 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAD21O60216 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAD21O60216 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RAD21O60216 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RAD21O60216 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
RAD21O60216 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RAD21O60216 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RAD21O60216 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RAD21O60216 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RAD21O60216 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RAD21O60216 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RAD21O60216 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RAD21O60216 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RAD21O60216 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RAD21O60216 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RAD21O60216 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RAD21O60216 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAD21O60216 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAD21O60216 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAD21O60216 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAD21O60216 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAD21O60216 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAD21O60216 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms