Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PLXNB1O43157 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PLXNB1O43157 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PLXNB1O43157 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PLXNB1O43157 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PLXNB1O43157 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PLXNB1O43157 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PLXNB1O43157 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PLXNB1O43157 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PLXNB1O43157 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PLXNB1O43157 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PLXNB1O43157 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PLXNB1O43157 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PLXNB1O43157 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PLXNB1O43157 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PLXNB1O43157 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PLXNB1O43157 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PLXNB1O43157 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLXNB1O43157 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLXNB1O43157 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLXNB1O43157 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLXNB1O43157 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLXNB1O43157 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLXNB1O43157 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLXNB1O43157 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLXNB1O43157 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLXNB1O43157 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLXNB1O43157 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLXNB1O43157 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLXNB1O43157 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLXNB1O43157 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PLXNB1O43157 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLXNB1O43157 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLXNB1O43157 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLXNB1O43157 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLXNB1O43157 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLXNB1O43157 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLXNB1O43157 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLXNB1O43157 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLXNB1O43157 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLXNB1O43157 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLXNB1O43157 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLXNB1O43157 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLXNB1O43157 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PLXNB1O43157 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PLXNB1O43157 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLXNB1O43157 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLXNB1O43157 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLXNB1O43157 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLXNB1O43157 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLXNB1O43157 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLXNB1O43157 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PLXNB1O43157 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLXNB1O43157 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLXNB1O43157 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLXNB1O43157 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLXNB1O43157 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLXNB1O43157 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLXNB1O43157 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLXNB1O43157 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLXNB1O43157 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLXNB1O43157 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLXNB1O43157 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLXNB1O43157 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PLXNB1O43157 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PLXNB1O43157 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PLXNB1O43157 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PLXNB1O43157 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PLXNB1O43157 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PLXNB1O43157 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PLXNB1O43157 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PLXNB1O43157 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PLXNB1O43157 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PLXNB1O43157 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLXNB1O43157 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLXNB1O43157 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLXNB1O43157 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLXNB1O43157 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLXNB1O43157 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLXNB1O43157 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLXNB1O43157 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLXNB1O43157 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLXNB1O43157 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLXNB1O43157 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLXNB1O43157 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLXNB1O43157 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PLXNB1O43157 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLXNB1O43157 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLXNB1O43157 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLXNB1O43157 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLXNB1O43157 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLXNB1O43157 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLXNB1O43157 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLXNB1O43157 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLXNB1O43157 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLXNB1O43157 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLXNB1O43157 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLXNB1O43157 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLXNB1O43157 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLXNB1O43157 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.6 ms