Protein–RNA interactions for Protein: O15049

N4BP3, NEDD4-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP3O15049 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
N4BP3O15049 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
N4BP3O15049 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
N4BP3O15049 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
N4BP3O15049 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
N4BP3O15049 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
N4BP3O15049 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
N4BP3O15049 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
N4BP3O15049 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
N4BP3O15049 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
N4BP3O15049 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
N4BP3O15049 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
N4BP3O15049 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
N4BP3O15049 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
N4BP3O15049 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
N4BP3O15049 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
N4BP3O15049 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
N4BP3O15049 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
N4BP3O15049 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
N4BP3O15049 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
N4BP3O15049 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
N4BP3O15049 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
N4BP3O15049 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
N4BP3O15049 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
N4BP3O15049 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
N4BP3O15049 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
N4BP3O15049 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
N4BP3O15049 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
N4BP3O15049 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
N4BP3O15049 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
N4BP3O15049 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
N4BP3O15049 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
N4BP3O15049 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
N4BP3O15049 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
N4BP3O15049 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
N4BP3O15049 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
N4BP3O15049 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
N4BP3O15049 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
N4BP3O15049 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
N4BP3O15049 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
N4BP3O15049 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
N4BP3O15049 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
N4BP3O15049 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
N4BP3O15049 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
N4BP3O15049 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
N4BP3O15049 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
N4BP3O15049 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
N4BP3O15049 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
N4BP3O15049 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
N4BP3O15049 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
N4BP3O15049 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
N4BP3O15049 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
N4BP3O15049 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
N4BP3O15049 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
N4BP3O15049 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
N4BP3O15049 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
N4BP3O15049 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
N4BP3O15049 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
N4BP3O15049 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
N4BP3O15049 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
N4BP3O15049 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
N4BP3O15049 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
N4BP3O15049 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
N4BP3O15049 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
N4BP3O15049 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
N4BP3O15049 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
N4BP3O15049 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
N4BP3O15049 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
N4BP3O15049 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
N4BP3O15049 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
N4BP3O15049 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
N4BP3O15049 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
N4BP3O15049 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
N4BP3O15049 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
N4BP3O15049 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
N4BP3O15049 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
N4BP3O15049 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
N4BP3O15049 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
N4BP3O15049 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
N4BP3O15049 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
N4BP3O15049 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
N4BP3O15049 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
N4BP3O15049 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
N4BP3O15049 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
N4BP3O15049 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
N4BP3O15049 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
N4BP3O15049 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
N4BP3O15049 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
N4BP3O15049 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
N4BP3O15049 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
N4BP3O15049 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
N4BP3O15049 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
N4BP3O15049 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
N4BP3O15049 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
N4BP3O15049 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
N4BP3O15049 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
N4BP3O15049 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
N4BP3O15049 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
N4BP3O15049 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
N4BP3O15049 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms