Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SEMA3EO15041 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SEMA3EO15041 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SEMA3EO15041 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SEMA3EO15041 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SEMA3EO15041 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SEMA3EO15041 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SEMA3EO15041 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SEMA3EO15041 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SEMA3EO15041 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SEMA3EO15041 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SEMA3EO15041 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SEMA3EO15041 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SEMA3EO15041 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SEMA3EO15041 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SEMA3EO15041 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SEMA3EO15041 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SEMA3EO15041 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SEMA3EO15041 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SEMA3EO15041 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SEMA3EO15041 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SEMA3EO15041 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SEMA3EO15041 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SEMA3EO15041 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SEMA3EO15041 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SEMA3EO15041 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SEMA3EO15041 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SEMA3EO15041 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SEMA3EO15041 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SEMA3EO15041 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SEMA3EO15041 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SEMA3EO15041 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SEMA3EO15041 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SEMA3EO15041 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SEMA3EO15041 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SEMA3EO15041 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SEMA3EO15041 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SEMA3EO15041 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SEMA3EO15041 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SEMA3EO15041 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SEMA3EO15041 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SEMA3EO15041 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SEMA3EO15041 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SEMA3EO15041 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SEMA3EO15041 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SEMA3EO15041 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SEMA3EO15041 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SEMA3EO15041 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SEMA3EO15041 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SEMA3EO15041 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SEMA3EO15041 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SEMA3EO15041 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SEMA3EO15041 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SEMA3EO15041 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SEMA3EO15041 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SEMA3EO15041 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SEMA3EO15041 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SEMA3EO15041 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SEMA3EO15041 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SEMA3EO15041 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SEMA3EO15041 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SEMA3EO15041 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SEMA3EO15041 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SEMA3EO15041 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SEMA3EO15041 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SEMA3EO15041 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SEMA3EO15041 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SEMA3EO15041 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SEMA3EO15041 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SEMA3EO15041 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SEMA3EO15041 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SEMA3EO15041 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SEMA3EO15041 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SEMA3EO15041 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SEMA3EO15041 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SEMA3EO15041 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SEMA3EO15041 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SEMA3EO15041 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SEMA3EO15041 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SEMA3EO15041 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SEMA3EO15041 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
SEMA3EO15041 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SEMA3EO15041 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SEMA3EO15041 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SEMA3EO15041 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SEMA3EO15041 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SEMA3EO15041 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SEMA3EO15041 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SEMA3EO15041 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SEMA3EO15041 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SEMA3EO15041 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SEMA3EO15041 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SEMA3EO15041 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SEMA3EO15041 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SEMA3EO15041 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SEMA3EO15041 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SEMA3EO15041 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SEMA3EO15041 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SEMA3EO15041 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SEMA3EO15041 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms