Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLGNO14967 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CLGNO14967 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLGNO14967 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLGNO14967 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLGNO14967 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLGNO14967 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLGNO14967 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLGNO14967 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLGNO14967 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLGNO14967 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CLGNO14967 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLGNO14967 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLGNO14967 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLGNO14967 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLGNO14967 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLGNO14967 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLGNO14967 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLGNO14967 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLGNO14967 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLGNO14967 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLGNO14967 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLGNO14967 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLGNO14967 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CLGNO14967 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLGNO14967 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLGNO14967 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLGNO14967 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLGNO14967 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLGNO14967 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLGNO14967 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLGNO14967 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLGNO14967 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLGNO14967 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLGNO14967 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLGNO14967 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLGNO14967 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLGNO14967 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLGNO14967 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLGNO14967 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLGNO14967 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLGNO14967 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLGNO14967 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLGNO14967 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLGNO14967 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLGNO14967 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLGNO14967 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLGNO14967 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CLGNO14967 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CLGNO14967 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLGNO14967 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLGNO14967 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLGNO14967 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLGNO14967 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLGNO14967 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLGNO14967 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLGNO14967 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLGNO14967 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLGNO14967 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLGNO14967 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLGNO14967 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLGNO14967 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLGNO14967 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLGNO14967 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLGNO14967 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLGNO14967 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CLGNO14967 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLGNO14967 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLGNO14967 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLGNO14967 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLGNO14967 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLGNO14967 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLGNO14967 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLGNO14967 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLGNO14967 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLGNO14967 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLGNO14967 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLGNO14967 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLGNO14967 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLGNO14967 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLGNO14967 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLGNO14967 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLGNO14967 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLGNO14967 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLGNO14967 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLGNO14967 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLGNO14967 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLGNO14967 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLGNO14967 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLGNO14967 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLGNO14967 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLGNO14967 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CLGNO14967 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLGNO14967 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLGNO14967 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLGNO14967 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLGNO14967 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLGNO14967 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CLGNO14967 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLGNO14967 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms