Protein–RNA interactions for Protein: O00635

TRIM38, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM38, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM38O00635 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM38O00635 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM38O00635 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM38O00635 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM38O00635 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM38O00635 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM38O00635 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM38O00635 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM38O00635 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM38O00635 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM38O00635 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM38O00635 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM38O00635 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM38O00635 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM38O00635 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM38O00635 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM38O00635 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM38O00635 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM38O00635 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM38O00635 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM38O00635 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM38O00635 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM38O00635 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM38O00635 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM38O00635 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM38O00635 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM38O00635 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM38O00635 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM38O00635 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM38O00635 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM38O00635 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM38O00635 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM38O00635 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM38O00635 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM38O00635 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM38O00635 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM38O00635 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM38O00635 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM38O00635 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM38O00635 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM38O00635 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM38O00635 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM38O00635 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM38O00635 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM38O00635 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM38O00635 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM38O00635 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM38O00635 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM38O00635 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM38O00635 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM38O00635 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM38O00635 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM38O00635 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM38O00635 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM38O00635 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM38O00635 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM38O00635 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM38O00635 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM38O00635 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM38O00635 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM38O00635 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM38O00635 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM38O00635 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM38O00635 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM38O00635 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM38O00635 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM38O00635 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM38O00635 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM38O00635 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM38O00635 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM38O00635 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM38O00635 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM38O00635 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM38O00635 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM38O00635 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM38O00635 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRIM38O00635 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM38O00635 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM38O00635 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM38O00635 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM38O00635 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM38O00635 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM38O00635 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM38O00635 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM38O00635 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM38O00635 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM38O00635 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM38O00635 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM38O00635 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM38O00635 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM38O00635 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM38O00635 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM38O00635 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM38O00635 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM38O00635 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM38O00635 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM38O00635 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM38O00635 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM38O00635 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM38O00635 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124 ms