Protein–RNA interactions for Protein: O00294

TULP1, Tubby-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP1O00294 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TULP1O00294 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TULP1O00294 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TULP1O00294 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TULP1O00294 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TULP1O00294 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TULP1O00294 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TULP1O00294 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TULP1O00294 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TULP1O00294 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TULP1O00294 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TULP1O00294 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TULP1O00294 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TULP1O00294 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TULP1O00294 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TULP1O00294 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TULP1O00294 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TULP1O00294 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TULP1O00294 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TULP1O00294 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TULP1O00294 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TULP1O00294 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TULP1O00294 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TULP1O00294 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TULP1O00294 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TULP1O00294 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TULP1O00294 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TULP1O00294 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TULP1O00294 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TULP1O00294 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TULP1O00294 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TULP1O00294 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TULP1O00294 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TULP1O00294 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TULP1O00294 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TULP1O00294 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TULP1O00294 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TULP1O00294 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TULP1O00294 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TULP1O00294 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TULP1O00294 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TULP1O00294 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TULP1O00294 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TULP1O00294 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TULP1O00294 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TULP1O00294 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TULP1O00294 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TULP1O00294 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TULP1O00294 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TULP1O00294 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TULP1O00294 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TULP1O00294 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TULP1O00294 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TULP1O00294 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TULP1O00294 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TULP1O00294 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TULP1O00294 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TULP1O00294 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TULP1O00294 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TULP1O00294 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TULP1O00294 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TULP1O00294 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TULP1O00294 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TULP1O00294 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TULP1O00294 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TULP1O00294 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TULP1O00294 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TULP1O00294 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TULP1O00294 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TULP1O00294 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TULP1O00294 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TULP1O00294 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TULP1O00294 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TULP1O00294 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TULP1O00294 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TULP1O00294 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TULP1O00294 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TULP1O00294 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TULP1O00294 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TULP1O00294 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TULP1O00294 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TULP1O00294 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TULP1O00294 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TULP1O00294 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TULP1O00294 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TULP1O00294 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TULP1O00294 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TULP1O00294 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TULP1O00294 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TULP1O00294 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TULP1O00294 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TULP1O00294 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TULP1O00294 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TULP1O00294 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TULP1O00294 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TULP1O00294 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TULP1O00294 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TULP1O00294 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TULP1O00294 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TULP1O00294 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms