Protein–RNA interactions for Protein: C9J366

IQCJ-SCHIP1, IQCJ-SCHIP1 readthrough, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQCJ-SCHIP1C9J366 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IQCJ-SCHIP1C9J366 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
IQCJ-SCHIP1C9J366 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
IQCJ-SCHIP1C9J366 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IQCJ-SCHIP1C9J366 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IQCJ-SCHIP1C9J366 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IQCJ-SCHIP1C9J366 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IQCJ-SCHIP1C9J366 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IQCJ-SCHIP1C9J366 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IQCJ-SCHIP1C9J366 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IQCJ-SCHIP1C9J366 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IQCJ-SCHIP1C9J366 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IQCJ-SCHIP1C9J366 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IQCJ-SCHIP1C9J366 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IQCJ-SCHIP1C9J366 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IQCJ-SCHIP1C9J366 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IQCJ-SCHIP1C9J366 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IQCJ-SCHIP1C9J366 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IQCJ-SCHIP1C9J366 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IQCJ-SCHIP1C9J366 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IQCJ-SCHIP1C9J366 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IQCJ-SCHIP1C9J366 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IQCJ-SCHIP1C9J366 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IQCJ-SCHIP1C9J366 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IQCJ-SCHIP1C9J366 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
IQCJ-SCHIP1C9J366 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IQCJ-SCHIP1C9J366 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IQCJ-SCHIP1C9J366 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IQCJ-SCHIP1C9J366 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IQCJ-SCHIP1C9J366 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
IQCJ-SCHIP1C9J366 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IQCJ-SCHIP1C9J366 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IQCJ-SCHIP1C9J366 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IQCJ-SCHIP1C9J366 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IQCJ-SCHIP1C9J366 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IQCJ-SCHIP1C9J366 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IQCJ-SCHIP1C9J366 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IQCJ-SCHIP1C9J366 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IQCJ-SCHIP1C9J366 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
IQCJ-SCHIP1C9J366 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IQCJ-SCHIP1C9J366 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IQCJ-SCHIP1C9J366 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IQCJ-SCHIP1C9J366 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms