Protein–RNA interactions for Protein: A6PVI3

NCBP2L, Nuclear cap-binding protein subunit 2-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP2LA6PVI3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCBP2LA6PVI3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCBP2LA6PVI3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCBP2LA6PVI3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCBP2LA6PVI3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCBP2LA6PVI3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCBP2LA6PVI3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCBP2LA6PVI3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCBP2LA6PVI3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCBP2LA6PVI3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCBP2LA6PVI3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCBP2LA6PVI3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCBP2LA6PVI3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCBP2LA6PVI3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCBP2LA6PVI3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCBP2LA6PVI3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCBP2LA6PVI3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCBP2LA6PVI3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCBP2LA6PVI3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCBP2LA6PVI3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCBP2LA6PVI3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCBP2LA6PVI3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCBP2LA6PVI3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCBP2LA6PVI3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCBP2LA6PVI3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCBP2LA6PVI3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCBP2LA6PVI3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NCBP2LA6PVI3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCBP2LA6PVI3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCBP2LA6PVI3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NCBP2LA6PVI3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCBP2LA6PVI3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCBP2LA6PVI3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCBP2LA6PVI3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCBP2LA6PVI3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCBP2LA6PVI3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCBP2LA6PVI3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCBP2LA6PVI3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCBP2LA6PVI3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCBP2LA6PVI3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCBP2LA6PVI3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NCBP2LA6PVI3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NCBP2LA6PVI3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NCBP2LA6PVI3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NCBP2LA6PVI3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NCBP2LA6PVI3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NCBP2LA6PVI3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NCBP2LA6PVI3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NCBP2LA6PVI3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NCBP2LA6PVI3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NCBP2LA6PVI3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NCBP2LA6PVI3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NCBP2LA6PVI3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NCBP2LA6PVI3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NCBP2LA6PVI3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NCBP2LA6PVI3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NCBP2LA6PVI3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NCBP2LA6PVI3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NCBP2LA6PVI3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NCBP2LA6PVI3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NCBP2LA6PVI3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NCBP2LA6PVI3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NCBP2LA6PVI3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NCBP2LA6PVI3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NCBP2LA6PVI3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NCBP2LA6PVI3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NCBP2LA6PVI3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NCBP2LA6PVI3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NCBP2LA6PVI3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NCBP2LA6PVI3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NCBP2LA6PVI3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NCBP2LA6PVI3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NCBP2LA6PVI3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NCBP2LA6PVI3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NCBP2LA6PVI3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NCBP2LA6PVI3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NCBP2LA6PVI3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NCBP2LA6PVI3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NCBP2LA6PVI3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NCBP2LA6PVI3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NCBP2LA6PVI3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NCBP2LA6PVI3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NCBP2LA6PVI3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NCBP2LA6PVI3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NCBP2LA6PVI3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NCBP2LA6PVI3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NCBP2LA6PVI3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NCBP2LA6PVI3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NCBP2LA6PVI3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NCBP2LA6PVI3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NCBP2LA6PVI3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NCBP2LA6PVI3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NCBP2LA6PVI3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NCBP2LA6PVI3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NCBP2LA6PVI3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NCBP2LA6PVI3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NCBP2LA6PVI3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NCBP2LA6PVI3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NCBP2LA6PVI3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NCBP2LA6PVI3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms