Protein–RNA interactions for Protein: A6NFU8

PGPEP1L, Pyroglutamyl-peptidase 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1LA6NFU8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGPEP1LA6NFU8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGPEP1LA6NFU8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGPEP1LA6NFU8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGPEP1LA6NFU8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGPEP1LA6NFU8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGPEP1LA6NFU8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGPEP1LA6NFU8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGPEP1LA6NFU8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGPEP1LA6NFU8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGPEP1LA6NFU8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PGPEP1LA6NFU8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGPEP1LA6NFU8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGPEP1LA6NFU8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGPEP1LA6NFU8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PGPEP1LA6NFU8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PGPEP1LA6NFU8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PGPEP1LA6NFU8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PGPEP1LA6NFU8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PGPEP1LA6NFU8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PGPEP1LA6NFU8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PGPEP1LA6NFU8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PGPEP1LA6NFU8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGPEP1LA6NFU8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGPEP1LA6NFU8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGPEP1LA6NFU8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGPEP1LA6NFU8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGPEP1LA6NFU8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGPEP1LA6NFU8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGPEP1LA6NFU8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGPEP1LA6NFU8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGPEP1LA6NFU8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGPEP1LA6NFU8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGPEP1LA6NFU8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGPEP1LA6NFU8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGPEP1LA6NFU8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGPEP1LA6NFU8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGPEP1LA6NFU8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGPEP1LA6NFU8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PGPEP1LA6NFU8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGPEP1LA6NFU8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGPEP1LA6NFU8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGPEP1LA6NFU8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGPEP1LA6NFU8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGPEP1LA6NFU8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGPEP1LA6NFU8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGPEP1LA6NFU8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGPEP1LA6NFU8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGPEP1LA6NFU8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGPEP1LA6NFU8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGPEP1LA6NFU8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGPEP1LA6NFU8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGPEP1LA6NFU8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGPEP1LA6NFU8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGPEP1LA6NFU8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGPEP1LA6NFU8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGPEP1LA6NFU8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGPEP1LA6NFU8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGPEP1LA6NFU8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGPEP1LA6NFU8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGPEP1LA6NFU8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGPEP1LA6NFU8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGPEP1LA6NFU8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGPEP1LA6NFU8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGPEP1LA6NFU8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGPEP1LA6NFU8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGPEP1LA6NFU8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGPEP1LA6NFU8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGPEP1LA6NFU8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGPEP1LA6NFU8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGPEP1LA6NFU8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGPEP1LA6NFU8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGPEP1LA6NFU8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGPEP1LA6NFU8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGPEP1LA6NFU8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PGPEP1LA6NFU8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGPEP1LA6NFU8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGPEP1LA6NFU8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGPEP1LA6NFU8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGPEP1LA6NFU8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGPEP1LA6NFU8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGPEP1LA6NFU8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGPEP1LA6NFU8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGPEP1LA6NFU8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PGPEP1LA6NFU8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGPEP1LA6NFU8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGPEP1LA6NFU8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGPEP1LA6NFU8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGPEP1LA6NFU8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGPEP1LA6NFU8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGPEP1LA6NFU8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGPEP1LA6NFU8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGPEP1LA6NFU8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PGPEP1LA6NFU8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGPEP1LA6NFU8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGPEP1LA6NFU8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGPEP1LA6NFU8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PGPEP1LA6NFU8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PGPEP1LA6NFU8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PGPEP1LA6NFU8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms