Protein–RNA interactions for Protein: A6NED2

RCCD1, RCC1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCCD1A6NED2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RCCD1A6NED2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RCCD1A6NED2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RCCD1A6NED2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RCCD1A6NED2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RCCD1A6NED2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RCCD1A6NED2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RCCD1A6NED2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RCCD1A6NED2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RCCD1A6NED2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RCCD1A6NED2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RCCD1A6NED2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RCCD1A6NED2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RCCD1A6NED2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RCCD1A6NED2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RCCD1A6NED2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RCCD1A6NED2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RCCD1A6NED2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RCCD1A6NED2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RCCD1A6NED2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RCCD1A6NED2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RCCD1A6NED2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RCCD1A6NED2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RCCD1A6NED2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RCCD1A6NED2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RCCD1A6NED2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RCCD1A6NED2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RCCD1A6NED2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RCCD1A6NED2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RCCD1A6NED2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RCCD1A6NED2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RCCD1A6NED2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RCCD1A6NED2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RCCD1A6NED2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RCCD1A6NED2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RCCD1A6NED2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RCCD1A6NED2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RCCD1A6NED2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RCCD1A6NED2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RCCD1A6NED2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RCCD1A6NED2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RCCD1A6NED2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RCCD1A6NED2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RCCD1A6NED2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RCCD1A6NED2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RCCD1A6NED2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RCCD1A6NED2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RCCD1A6NED2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RCCD1A6NED2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RCCD1A6NED2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RCCD1A6NED2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RCCD1A6NED2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RCCD1A6NED2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RCCD1A6NED2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RCCD1A6NED2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RCCD1A6NED2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RCCD1A6NED2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RCCD1A6NED2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RCCD1A6NED2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RCCD1A6NED2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RCCD1A6NED2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RCCD1A6NED2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RCCD1A6NED2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RCCD1A6NED2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RCCD1A6NED2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RCCD1A6NED2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RCCD1A6NED2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RCCD1A6NED2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RCCD1A6NED2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RCCD1A6NED2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RCCD1A6NED2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RCCD1A6NED2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RCCD1A6NED2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RCCD1A6NED2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RCCD1A6NED2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RCCD1A6NED2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RCCD1A6NED2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RCCD1A6NED2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RCCD1A6NED2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RCCD1A6NED2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RCCD1A6NED2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RCCD1A6NED2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RCCD1A6NED2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RCCD1A6NED2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RCCD1A6NED2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RCCD1A6NED2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RCCD1A6NED2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RCCD1A6NED2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RCCD1A6NED2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RCCD1A6NED2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RCCD1A6NED2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RCCD1A6NED2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RCCD1A6NED2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RCCD1A6NED2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RCCD1A6NED2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RCCD1A6NED2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RCCD1A6NED2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RCCD1A6NED2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RCCD1A6NED2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RCCD1A6NED2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms