Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PALM3A6NDB9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PALM3A6NDB9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PALM3A6NDB9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PALM3A6NDB9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PALM3A6NDB9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PALM3A6NDB9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PALM3A6NDB9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PALM3A6NDB9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PALM3A6NDB9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PALM3A6NDB9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PALM3A6NDB9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PALM3A6NDB9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PALM3A6NDB9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PALM3A6NDB9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PALM3A6NDB9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PALM3A6NDB9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PALM3A6NDB9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PALM3A6NDB9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PALM3A6NDB9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PALM3A6NDB9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PALM3A6NDB9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PALM3A6NDB9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PALM3A6NDB9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PALM3A6NDB9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PALM3A6NDB9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PALM3A6NDB9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PALM3A6NDB9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PALM3A6NDB9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PALM3A6NDB9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PALM3A6NDB9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PALM3A6NDB9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PALM3A6NDB9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PALM3A6NDB9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PALM3A6NDB9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PALM3A6NDB9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PALM3A6NDB9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PALM3A6NDB9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PALM3A6NDB9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
PALM3A6NDB9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PALM3A6NDB9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PALM3A6NDB9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PALM3A6NDB9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PALM3A6NDB9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PALM3A6NDB9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PALM3A6NDB9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PALM3A6NDB9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PALM3A6NDB9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PALM3A6NDB9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PALM3A6NDB9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PALM3A6NDB9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PALM3A6NDB9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PALM3A6NDB9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PALM3A6NDB9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PALM3A6NDB9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PALM3A6NDB9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PALM3A6NDB9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PALM3A6NDB9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PALM3A6NDB9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PALM3A6NDB9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PALM3A6NDB9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PALM3A6NDB9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PALM3A6NDB9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PALM3A6NDB9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PALM3A6NDB9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PALM3A6NDB9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PALM3A6NDB9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PALM3A6NDB9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PALM3A6NDB9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PALM3A6NDB9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PALM3A6NDB9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PALM3A6NDB9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PALM3A6NDB9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PALM3A6NDB9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PALM3A6NDB9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.51■■■□□ 2
PALM3A6NDB9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PALM3A6NDB9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PALM3A6NDB9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PALM3A6NDB9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PALM3A6NDB9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PALM3A6NDB9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PALM3A6NDB9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PALM3A6NDB9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PALM3A6NDB9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PALM3A6NDB9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PALM3A6NDB9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PALM3A6NDB9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PALM3A6NDB9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PALM3A6NDB9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PALM3A6NDB9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PALM3A6NDB9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PALM3A6NDB9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PALM3A6NDB9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PALM3A6NDB9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PALM3A6NDB9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PALM3A6NDB9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PALM3A6NDB9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PALM3A6NDB9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PALM3A6NDB9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PALM3A6NDB9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms