Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMX2A2RU54 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMX2A2RU54 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMX2A2RU54 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMX2A2RU54 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMX2A2RU54 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMX2A2RU54 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMX2A2RU54 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMX2A2RU54 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMX2A2RU54 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMX2A2RU54 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMX2A2RU54 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMX2A2RU54 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMX2A2RU54 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMX2A2RU54 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMX2A2RU54 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMX2A2RU54 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMX2A2RU54 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HMX2A2RU54 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMX2A2RU54 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMX2A2RU54 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMX2A2RU54 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMX2A2RU54 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMX2A2RU54 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMX2A2RU54 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMX2A2RU54 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMX2A2RU54 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMX2A2RU54 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMX2A2RU54 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMX2A2RU54 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMX2A2RU54 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMX2A2RU54 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMX2A2RU54 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMX2A2RU54 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HMX2A2RU54 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HMX2A2RU54 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HMX2A2RU54 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMX2A2RU54 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HMX2A2RU54 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMX2A2RU54 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMX2A2RU54 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMX2A2RU54 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMX2A2RU54 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMX2A2RU54 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMX2A2RU54 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMX2A2RU54 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMX2A2RU54 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMX2A2RU54 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMX2A2RU54 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMX2A2RU54 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMX2A2RU54 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HMX2A2RU54 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMX2A2RU54 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMX2A2RU54 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HMX2A2RU54 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMX2A2RU54 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMX2A2RU54 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMX2A2RU54 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMX2A2RU54 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMX2A2RU54 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMX2A2RU54 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMX2A2RU54 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMX2A2RU54 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMX2A2RU54 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMX2A2RU54 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMX2A2RU54 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMX2A2RU54 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMX2A2RU54 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMX2A2RU54 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMX2A2RU54 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMX2A2RU54 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMX2A2RU54 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMX2A2RU54 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMX2A2RU54 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMX2A2RU54 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMX2A2RU54 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HMX2A2RU54 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMX2A2RU54 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMX2A2RU54 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMX2A2RU54 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMX2A2RU54 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMX2A2RU54 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMX2A2RU54 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMX2A2RU54 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMX2A2RU54 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMX2A2RU54 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMX2A2RU54 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMX2A2RU54 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMX2A2RU54 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMX2A2RU54 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMX2A2RU54 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMX2A2RU54 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMX2A2RU54 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMX2A2RU54 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMX2A2RU54 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMX2A2RU54 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMX2A2RU54 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMX2A2RU54 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMX2A2RU54 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMX2A2RU54 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms