Protein–RNA interactions for Protein: V9GYQ6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYQ6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
V9GYQ6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
V9GYQ6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
V9GYQ6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
V9GYQ6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
V9GYQ6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
V9GYQ6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
V9GYQ6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
V9GYQ6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
V9GYQ6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
V9GYQ6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
V9GYQ6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
V9GYQ6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
V9GYQ6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
V9GYQ6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
V9GYQ6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
V9GYQ6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
V9GYQ6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
V9GYQ6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
V9GYQ6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
V9GYQ6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
V9GYQ6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
V9GYQ6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
V9GYQ6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
V9GYQ6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
V9GYQ6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
V9GYQ6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
V9GYQ6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
V9GYQ6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
V9GYQ6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
V9GYQ6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
V9GYQ6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
V9GYQ6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
V9GYQ6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
V9GYQ6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
V9GYQ6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
V9GYQ6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
V9GYQ6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
V9GYQ6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
V9GYQ6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
V9GYQ6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
V9GYQ6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
V9GYQ6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
V9GYQ6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
V9GYQ6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
V9GYQ6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
V9GYQ6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
V9GYQ6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
V9GYQ6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
V9GYQ6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
V9GYQ6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
V9GYQ6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
V9GYQ6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
V9GYQ6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
V9GYQ6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
V9GYQ6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
V9GYQ6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
V9GYQ6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
V9GYQ6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
V9GYQ6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
V9GYQ6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
V9GYQ6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
V9GYQ6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
V9GYQ6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
V9GYQ6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
V9GYQ6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
V9GYQ6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
V9GYQ6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
V9GYQ6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
V9GYQ6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
V9GYQ6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
V9GYQ6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
V9GYQ6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
V9GYQ6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
V9GYQ6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
V9GYQ6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
V9GYQ6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
V9GYQ6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
V9GYQ6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
V9GYQ6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
V9GYQ6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
V9GYQ6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
V9GYQ6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
V9GYQ6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
V9GYQ6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
V9GYQ6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
V9GYQ6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
V9GYQ6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
V9GYQ6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
V9GYQ6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
V9GYQ6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
V9GYQ6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
V9GYQ6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
V9GYQ6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
V9GYQ6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
V9GYQ6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
V9GYQ6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
V9GYQ6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
V9GYQ6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
V9GYQ6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms