Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX13Q9Y5W8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX13Q9Y5W8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX13Q9Y5W8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX13Q9Y5W8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX13Q9Y5W8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX13Q9Y5W8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX13Q9Y5W8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX13Q9Y5W8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX13Q9Y5W8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX13Q9Y5W8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX13Q9Y5W8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX13Q9Y5W8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX13Q9Y5W8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX13Q9Y5W8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX13Q9Y5W8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX13Q9Y5W8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX13Q9Y5W8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX13Q9Y5W8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX13Q9Y5W8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX13Q9Y5W8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX13Q9Y5W8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX13Q9Y5W8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX13Q9Y5W8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX13Q9Y5W8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX13Q9Y5W8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX13Q9Y5W8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX13Q9Y5W8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX13Q9Y5W8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX13Q9Y5W8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX13Q9Y5W8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX13Q9Y5W8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX13Q9Y5W8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX13Q9Y5W8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX13Q9Y5W8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX13Q9Y5W8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX13Q9Y5W8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX13Q9Y5W8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX13Q9Y5W8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX13Q9Y5W8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX13Q9Y5W8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
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SNX13Q9Y5W8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX13Q9Y5W8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX13Q9Y5W8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX13Q9Y5W8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
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SNX13Q9Y5W8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX13Q9Y5W8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX13Q9Y5W8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNX13Q9Y5W8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
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SNX13Q9Y5W8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX13Q9Y5W8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX13Q9Y5W8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
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SNX13Q9Y5W8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX13Q9Y5W8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX13Q9Y5W8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX13Q9Y5W8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX13Q9Y5W8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
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SNX13Q9Y5W8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
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SNX13Q9Y5W8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
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SNX13Q9Y5W8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX13Q9Y5W8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
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SNX13Q9Y5W8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX13Q9Y5W8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX13Q9Y5W8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX13Q9Y5W8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX13Q9Y5W8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX13Q9Y5W8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX13Q9Y5W8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX13Q9Y5W8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX13Q9Y5W8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX13Q9Y5W8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX13Q9Y5W8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX13Q9Y5W8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX13Q9Y5W8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX13Q9Y5W8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX13Q9Y5W8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX13Q9Y5W8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX13Q9Y5W8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX13Q9Y5W8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX13Q9Y5W8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX13Q9Y5W8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX13Q9Y5W8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX13Q9Y5W8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX13Q9Y5W8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX13Q9Y5W8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
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