Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y324

FCF1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCF1Q9Y324 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FCF1Q9Y324 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FCF1Q9Y324 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FCF1Q9Y324 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FCF1Q9Y324 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FCF1Q9Y324 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FCF1Q9Y324 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FCF1Q9Y324 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FCF1Q9Y324 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
FCF1Q9Y324 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FCF1Q9Y324 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
FCF1Q9Y324 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FCF1Q9Y324 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FCF1Q9Y324 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FCF1Q9Y324 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FCF1Q9Y324 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FCF1Q9Y324 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FCF1Q9Y324 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FCF1Q9Y324 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FCF1Q9Y324 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FCF1Q9Y324 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FCF1Q9Y324 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FCF1Q9Y324 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FCF1Q9Y324 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FCF1Q9Y324 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FCF1Q9Y324 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FCF1Q9Y324 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FCF1Q9Y324 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FCF1Q9Y324 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FCF1Q9Y324 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FCF1Q9Y324 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FCF1Q9Y324 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FCF1Q9Y324 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FCF1Q9Y324 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FCF1Q9Y324 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FCF1Q9Y324 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FCF1Q9Y324 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FCF1Q9Y324 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FCF1Q9Y324 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FCF1Q9Y324 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FCF1Q9Y324 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FCF1Q9Y324 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FCF1Q9Y324 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FCF1Q9Y324 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FCF1Q9Y324 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FCF1Q9Y324 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FCF1Q9Y324 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FCF1Q9Y324 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FCF1Q9Y324 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FCF1Q9Y324 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FCF1Q9Y324 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FCF1Q9Y324 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FCF1Q9Y324 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FCF1Q9Y324 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FCF1Q9Y324 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FCF1Q9Y324 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FCF1Q9Y324 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FCF1Q9Y324 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FCF1Q9Y324 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FCF1Q9Y324 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FCF1Q9Y324 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FCF1Q9Y324 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FCF1Q9Y324 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FCF1Q9Y324 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FCF1Q9Y324 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FCF1Q9Y324 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FCF1Q9Y324 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FCF1Q9Y324 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FCF1Q9Y324 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FCF1Q9Y324 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FCF1Q9Y324 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FCF1Q9Y324 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FCF1Q9Y324 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FCF1Q9Y324 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FCF1Q9Y324 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FCF1Q9Y324 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FCF1Q9Y324 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FCF1Q9Y324 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FCF1Q9Y324 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FCF1Q9Y324 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FCF1Q9Y324 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FCF1Q9Y324 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FCF1Q9Y324 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FCF1Q9Y324 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FCF1Q9Y324 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FCF1Q9Y324 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FCF1Q9Y324 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FCF1Q9Y324 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FCF1Q9Y324 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FCF1Q9Y324 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FCF1Q9Y324 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FCF1Q9Y324 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FCF1Q9Y324 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FCF1Q9Y324 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FCF1Q9Y324 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FCF1Q9Y324 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FCF1Q9Y324 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FCF1Q9Y324 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FCF1Q9Y324 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FCF1Q9Y324 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms