Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL0

DDX25, ATP-dependent RNA helicase DDX25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX25Q9UHL0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX25Q9UHL0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX25Q9UHL0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDX25Q9UHL0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDX25Q9UHL0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
DDX25Q9UHL0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDX25Q9UHL0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDX25Q9UHL0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDX25Q9UHL0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDX25Q9UHL0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDX25Q9UHL0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDX25Q9UHL0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDX25Q9UHL0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDX25Q9UHL0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDX25Q9UHL0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDX25Q9UHL0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDX25Q9UHL0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
DDX25Q9UHL0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDX25Q9UHL0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDX25Q9UHL0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDX25Q9UHL0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDX25Q9UHL0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDX25Q9UHL0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDX25Q9UHL0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDX25Q9UHL0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDX25Q9UHL0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDX25Q9UHL0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDX25Q9UHL0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDX25Q9UHL0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDX25Q9UHL0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDX25Q9UHL0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDX25Q9UHL0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDX25Q9UHL0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDX25Q9UHL0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDX25Q9UHL0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDX25Q9UHL0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDX25Q9UHL0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDX25Q9UHL0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDX25Q9UHL0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDX25Q9UHL0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDX25Q9UHL0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDX25Q9UHL0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDX25Q9UHL0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
DDX25Q9UHL0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDX25Q9UHL0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDX25Q9UHL0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDX25Q9UHL0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDX25Q9UHL0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
DDX25Q9UHL0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDX25Q9UHL0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
DDX25Q9UHL0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDX25Q9UHL0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDX25Q9UHL0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDX25Q9UHL0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDX25Q9UHL0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDX25Q9UHL0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDX25Q9UHL0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDX25Q9UHL0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDX25Q9UHL0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDX25Q9UHL0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDX25Q9UHL0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDX25Q9UHL0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX25Q9UHL0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX25Q9UHL0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX25Q9UHL0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX25Q9UHL0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX25Q9UHL0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX25Q9UHL0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
DDX25Q9UHL0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
DDX25Q9UHL0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDX25Q9UHL0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDX25Q9UHL0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDX25Q9UHL0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDX25Q9UHL0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDX25Q9UHL0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDX25Q9UHL0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDX25Q9UHL0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDX25Q9UHL0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DDX25Q9UHL0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DDX25Q9UHL0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DDX25Q9UHL0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DDX25Q9UHL0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
DDX25Q9UHL0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDX25Q9UHL0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDX25Q9UHL0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDX25Q9UHL0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDX25Q9UHL0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDX25Q9UHL0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDX25Q9UHL0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDX25Q9UHL0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDX25Q9UHL0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDX25Q9UHL0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDX25Q9UHL0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDX25Q9UHL0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDX25Q9UHL0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDX25Q9UHL0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDX25Q9UHL0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDX25Q9UHL0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
DDX25Q9UHL0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDX25Q9UHL0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms