Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
NPC1L1Q9UHC9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
NPC1L1Q9UHC9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
NPC1L1Q9UHC9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
NPC1L1Q9UHC9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
NPC1L1Q9UHC9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
NPC1L1Q9UHC9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
NPC1L1Q9UHC9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
NPC1L1Q9UHC9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
NPC1L1Q9UHC9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
NPC1L1Q9UHC9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
NPC1L1Q9UHC9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
NPC1L1Q9UHC9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
NPC1L1Q9UHC9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
NPC1L1Q9UHC9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
NPC1L1Q9UHC9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
NPC1L1Q9UHC9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
NPC1L1Q9UHC9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
NPC1L1Q9UHC9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
NPC1L1Q9UHC9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
NPC1L1Q9UHC9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
NPC1L1Q9UHC9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
NPC1L1Q9UHC9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NPC1L1Q9UHC9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
NPC1L1Q9UHC9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
NPC1L1Q9UHC9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NPC1L1Q9UHC9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NPC1L1Q9UHC9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
NPC1L1Q9UHC9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
NPC1L1Q9UHC9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
NPC1L1Q9UHC9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
NPC1L1Q9UHC9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
NPC1L1Q9UHC9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
NPC1L1Q9UHC9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NPC1L1Q9UHC9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
NPC1L1Q9UHC9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
NPC1L1Q9UHC9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
NPC1L1Q9UHC9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NPC1L1Q9UHC9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
NPC1L1Q9UHC9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
NPC1L1Q9UHC9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
NPC1L1Q9UHC9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NPC1L1Q9UHC9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NPC1L1Q9UHC9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NPC1L1Q9UHC9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NPC1L1Q9UHC9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NPC1L1Q9UHC9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NPC1L1Q9UHC9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NPC1L1Q9UHC9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NPC1L1Q9UHC9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NPC1L1Q9UHC9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
NPC1L1Q9UHC9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
NPC1L1Q9UHC9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
NPC1L1Q9UHC9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
NPC1L1Q9UHC9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
NPC1L1Q9UHC9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.78
NPC1L1Q9UHC9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
NPC1L1Q9UHC9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
NPC1L1Q9UHC9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NPC1L1Q9UHC9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NPC1L1Q9UHC9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NPC1L1Q9UHC9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
NPC1L1Q9UHC9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NPC1L1Q9UHC9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
NPC1L1Q9UHC9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NPC1L1Q9UHC9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NPC1L1Q9UHC9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
NPC1L1Q9UHC9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NPC1L1Q9UHC9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
NPC1L1Q9UHC9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NPC1L1Q9UHC9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NPC1L1Q9UHC9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
NPC1L1Q9UHC9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NPC1L1Q9UHC9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NPC1L1Q9UHC9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NPC1L1Q9UHC9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NPC1L1Q9UHC9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NPC1L1Q9UHC9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NPC1L1Q9UHC9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NPC1L1Q9UHC9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NPC1L1Q9UHC9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NPC1L1Q9UHC9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NPC1L1Q9UHC9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NPC1L1Q9UHC9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NPC1L1Q9UHC9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NPC1L1Q9UHC9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
NPC1L1Q9UHC9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
NPC1L1Q9UHC9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NPC1L1Q9UHC9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NPC1L1Q9UHC9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
NPC1L1Q9UHC9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
NPC1L1Q9UHC9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
NPC1L1Q9UHC9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NPC1L1Q9UHC9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NPC1L1Q9UHC9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NPC1L1Q9UHC9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NPC1L1Q9UHC9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NPC1L1Q9UHC9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NPC1L1Q9UHC9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NPC1L1Q9UHC9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.4 ms