Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFD9

RIMBP3, RIMS-binding protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMBP3Q9UFD9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
RIMBP3Q9UFD9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC39.33■■■■□ 3.89
RIMBP3Q9UFD9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
RIMBP3Q9UFD9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC39.33■■■■□ 3.89
RIMBP3Q9UFD9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
RIMBP3Q9UFD9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC39.32■■■■□ 3.89
RIMBP3Q9UFD9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC39.32■■■■□ 3.89
RIMBP3Q9UFD9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC39.32■■■■□ 3.89
RIMBP3Q9UFD9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC39.32■■■■□ 3.89
RIMBP3Q9UFD9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
RIMBP3Q9UFD9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.88
RIMBP3Q9UFD9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
RIMBP3Q9UFD9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
RIMBP3Q9UFD9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
RIMBP3Q9UFD9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
RIMBP3Q9UFD9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
RIMBP3Q9UFD9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
RIMBP3Q9UFD9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC39.29■■■■□ 3.88
RIMBP3Q9UFD9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
RIMBP3Q9UFD9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.29■■■■□ 3.88
RIMBP3Q9UFD9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
RIMBP3Q9UFD9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
RIMBP3Q9UFD9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC39.29■■■■□ 3.88
RIMBP3Q9UFD9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC39.29■■■■□ 3.88
RIMBP3Q9UFD9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
RIMBP3Q9UFD9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
RIMBP3Q9UFD9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC39.27■■■■□ 3.88
RIMBP3Q9UFD9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC39.27■■■■□ 3.88
RIMBP3Q9UFD9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.27■■■■□ 3.88
RIMBP3Q9UFD9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
RIMBP3Q9UFD9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
RIMBP3Q9UFD9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
RIMBP3Q9UFD9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
RIMBP3Q9UFD9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
RIMBP3Q9UFD9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
RIMBP3Q9UFD9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
RIMBP3Q9UFD9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
RIMBP3Q9UFD9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC39.23■■■■□ 3.87
RIMBP3Q9UFD9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
RIMBP3Q9UFD9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC39.22■■■■□ 3.87
RIMBP3Q9UFD9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
RIMBP3Q9UFD9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
RIMBP3Q9UFD9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
RIMBP3Q9UFD9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
RIMBP3Q9UFD9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
RIMBP3Q9UFD9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
RIMBP3Q9UFD9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
RIMBP3Q9UFD9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
RIMBP3Q9UFD9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
RIMBP3Q9UFD9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC39.2■■■■□ 3.87
RIMBP3Q9UFD9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
RIMBP3Q9UFD9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
RIMBP3Q9UFD9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
RIMBP3Q9UFD9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
RIMBP3Q9UFD9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC39.19■■■■□ 3.86
RIMBP3Q9UFD9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
RIMBP3Q9UFD9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
RIMBP3Q9UFD9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
RIMBP3Q9UFD9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
RIMBP3Q9UFD9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC39.15■■■■□ 3.86
RIMBP3Q9UFD9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC39.15■■■■□ 3.86
RIMBP3Q9UFD9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
RIMBP3Q9UFD9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
RIMBP3Q9UFD9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
RIMBP3Q9UFD9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.86
RIMBP3Q9UFD9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.13■■■■□ 3.85
RIMBP3Q9UFD9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
RIMBP3Q9UFD9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC39.13■■■■□ 3.85
RIMBP3Q9UFD9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
RIMBP3Q9UFD9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
RIMBP3Q9UFD9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC39.12■■■■□ 3.85
RIMBP3Q9UFD9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
RIMBP3Q9UFD9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
RIMBP3Q9UFD9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC39.11■■■■□ 3.85
RIMBP3Q9UFD9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
RIMBP3Q9UFD9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
RIMBP3Q9UFD9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
RIMBP3Q9UFD9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
RIMBP3Q9UFD9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
RIMBP3Q9UFD9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
RIMBP3Q9UFD9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
RIMBP3Q9UFD9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
RIMBP3Q9UFD9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
RIMBP3Q9UFD9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.84
RIMBP3Q9UFD9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
RIMBP3Q9UFD9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
RIMBP3Q9UFD9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC39.07■■■■□ 3.84
RIMBP3Q9UFD9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
RIMBP3Q9UFD9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
RIMBP3Q9UFD9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
RIMBP3Q9UFD9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC39.06■■■■□ 3.84
RIMBP3Q9UFD9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC39.06■■■■□ 3.84
RIMBP3Q9UFD9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC39.06■■■■□ 3.84
RIMBP3Q9UFD9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
RIMBP3Q9UFD9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
RIMBP3Q9UFD9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
RIMBP3Q9UFD9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC39.04■■■■□ 3.84
RIMBP3Q9UFD9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
RIMBP3Q9UFD9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
RIMBP3Q9UFD9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms