Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DKK2Q9UBU2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DKK2Q9UBU2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DKK2Q9UBU2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DKK2Q9UBU2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DKK2Q9UBU2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DKK2Q9UBU2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DKK2Q9UBU2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DKK2Q9UBU2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DKK2Q9UBU2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DKK2Q9UBU2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DKK2Q9UBU2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DKK2Q9UBU2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DKK2Q9UBU2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DKK2Q9UBU2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DKK2Q9UBU2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DKK2Q9UBU2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DKK2Q9UBU2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DKK2Q9UBU2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DKK2Q9UBU2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
DKK2Q9UBU2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DKK2Q9UBU2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DKK2Q9UBU2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DKK2Q9UBU2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DKK2Q9UBU2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DKK2Q9UBU2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DKK2Q9UBU2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DKK2Q9UBU2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DKK2Q9UBU2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DKK2Q9UBU2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DKK2Q9UBU2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DKK2Q9UBU2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
DKK2Q9UBU2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DKK2Q9UBU2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DKK2Q9UBU2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DKK2Q9UBU2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DKK2Q9UBU2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DKK2Q9UBU2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DKK2Q9UBU2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DKK2Q9UBU2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
DKK2Q9UBU2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DKK2Q9UBU2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DKK2Q9UBU2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
DKK2Q9UBU2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DKK2Q9UBU2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DKK2Q9UBU2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DKK2Q9UBU2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DKK2Q9UBU2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
DKK2Q9UBU2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DKK2Q9UBU2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DKK2Q9UBU2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DKK2Q9UBU2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DKK2Q9UBU2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DKK2Q9UBU2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DKK2Q9UBU2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DKK2Q9UBU2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DKK2Q9UBU2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DKK2Q9UBU2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DKK2Q9UBU2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DKK2Q9UBU2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DKK2Q9UBU2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DKK2Q9UBU2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DKK2Q9UBU2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DKK2Q9UBU2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DKK2Q9UBU2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
DKK2Q9UBU2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DKK2Q9UBU2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DKK2Q9UBU2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DKK2Q9UBU2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DKK2Q9UBU2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DKK2Q9UBU2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DKK2Q9UBU2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DKK2Q9UBU2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DKK2Q9UBU2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DKK2Q9UBU2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DKK2Q9UBU2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DKK2Q9UBU2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DKK2Q9UBU2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DKK2Q9UBU2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DKK2Q9UBU2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DKK2Q9UBU2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DKK2Q9UBU2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DKK2Q9UBU2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DKK2Q9UBU2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DKK2Q9UBU2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DKK2Q9UBU2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DKK2Q9UBU2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DKK2Q9UBU2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
DKK2Q9UBU2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DKK2Q9UBU2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DKK2Q9UBU2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DKK2Q9UBU2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DKK2Q9UBU2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DKK2Q9UBU2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DKK2Q9UBU2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DKK2Q9UBU2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DKK2Q9UBU2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DKK2Q9UBU2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DKK2Q9UBU2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DKK2Q9UBU2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms