Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSD3Q9NYI0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSD3Q9NYI0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSD3Q9NYI0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSD3Q9NYI0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSD3Q9NYI0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSD3Q9NYI0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSD3Q9NYI0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSD3Q9NYI0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSD3Q9NYI0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSD3Q9NYI0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSD3Q9NYI0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSD3Q9NYI0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSD3Q9NYI0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSD3Q9NYI0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSD3Q9NYI0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSD3Q9NYI0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSD3Q9NYI0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSD3Q9NYI0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSD3Q9NYI0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSD3Q9NYI0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSD3Q9NYI0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSD3Q9NYI0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSD3Q9NYI0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSD3Q9NYI0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSD3Q9NYI0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSD3Q9NYI0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSD3Q9NYI0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSD3Q9NYI0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSD3Q9NYI0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSD3Q9NYI0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSD3Q9NYI0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSD3Q9NYI0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSD3Q9NYI0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSD3Q9NYI0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSD3Q9NYI0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSD3Q9NYI0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSD3Q9NYI0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSD3Q9NYI0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSD3Q9NYI0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSD3Q9NYI0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PSD3Q9NYI0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSD3Q9NYI0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSD3Q9NYI0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSD3Q9NYI0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSD3Q9NYI0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSD3Q9NYI0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSD3Q9NYI0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSD3Q9NYI0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSD3Q9NYI0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSD3Q9NYI0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSD3Q9NYI0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSD3Q9NYI0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSD3Q9NYI0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSD3Q9NYI0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSD3Q9NYI0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSD3Q9NYI0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSD3Q9NYI0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSD3Q9NYI0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSD3Q9NYI0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSD3Q9NYI0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSD3Q9NYI0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSD3Q9NYI0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSD3Q9NYI0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSD3Q9NYI0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSD3Q9NYI0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSD3Q9NYI0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSD3Q9NYI0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSD3Q9NYI0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSD3Q9NYI0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSD3Q9NYI0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSD3Q9NYI0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSD3Q9NYI0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSD3Q9NYI0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PSD3Q9NYI0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSD3Q9NYI0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSD3Q9NYI0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSD3Q9NYI0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PSD3Q9NYI0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PSD3Q9NYI0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSD3Q9NYI0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSD3Q9NYI0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSD3Q9NYI0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSD3Q9NYI0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSD3Q9NYI0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSD3Q9NYI0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSD3Q9NYI0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSD3Q9NYI0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSD3Q9NYI0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSD3Q9NYI0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSD3Q9NYI0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSD3Q9NYI0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSD3Q9NYI0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSD3Q9NYI0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSD3Q9NYI0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSD3Q9NYI0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSD3Q9NYI0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSD3Q9NYI0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSD3Q9NYI0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSD3Q9NYI0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms