Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY65

TUBA8, Tubulin alpha-8 chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA8Q9NY65 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBA8Q9NY65 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBA8Q9NY65 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBA8Q9NY65 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBA8Q9NY65 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBA8Q9NY65 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBA8Q9NY65 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBA8Q9NY65 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBA8Q9NY65 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBA8Q9NY65 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBA8Q9NY65 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBA8Q9NY65 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBA8Q9NY65 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBA8Q9NY65 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBA8Q9NY65 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBA8Q9NY65 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBA8Q9NY65 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBA8Q9NY65 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBA8Q9NY65 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBA8Q9NY65 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBA8Q9NY65 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBA8Q9NY65 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBA8Q9NY65 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBA8Q9NY65 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBA8Q9NY65 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBA8Q9NY65 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBA8Q9NY65 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBA8Q9NY65 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBA8Q9NY65 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBA8Q9NY65 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBA8Q9NY65 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBA8Q9NY65 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBA8Q9NY65 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBA8Q9NY65 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TUBA8Q9NY65 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TUBA8Q9NY65 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBA8Q9NY65 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBA8Q9NY65 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBA8Q9NY65 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBA8Q9NY65 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBA8Q9NY65 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBA8Q9NY65 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBA8Q9NY65 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBA8Q9NY65 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBA8Q9NY65 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBA8Q9NY65 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBA8Q9NY65 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBA8Q9NY65 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBA8Q9NY65 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBA8Q9NY65 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBA8Q9NY65 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBA8Q9NY65 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBA8Q9NY65 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBA8Q9NY65 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBA8Q9NY65 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBA8Q9NY65 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBA8Q9NY65 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBA8Q9NY65 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBA8Q9NY65 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBA8Q9NY65 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBA8Q9NY65 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBA8Q9NY65 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBA8Q9NY65 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBA8Q9NY65 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBA8Q9NY65 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBA8Q9NY65 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBA8Q9NY65 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBA8Q9NY65 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBA8Q9NY65 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBA8Q9NY65 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBA8Q9NY65 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBA8Q9NY65 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBA8Q9NY65 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBA8Q9NY65 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBA8Q9NY65 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBA8Q9NY65 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBA8Q9NY65 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBA8Q9NY65 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBA8Q9NY65 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBA8Q9NY65 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBA8Q9NY65 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBA8Q9NY65 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBA8Q9NY65 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBA8Q9NY65 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBA8Q9NY65 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBA8Q9NY65 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBA8Q9NY65 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBA8Q9NY65 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBA8Q9NY65 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TUBA8Q9NY65 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TUBA8Q9NY65 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBA8Q9NY65 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBA8Q9NY65 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBA8Q9NY65 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBA8Q9NY65 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBA8Q9NY65 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBA8Q9NY65 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBA8Q9NY65 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBA8Q9NY65 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBA8Q9NY65 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms