Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
APOBEC3GQ9HC16 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
APOBEC3GQ9HC16 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
APOBEC3GQ9HC16 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
APOBEC3GQ9HC16 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
APOBEC3GQ9HC16 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
APOBEC3GQ9HC16 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
APOBEC3GQ9HC16 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
APOBEC3GQ9HC16 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
APOBEC3GQ9HC16 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
APOBEC3GQ9HC16 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
APOBEC3GQ9HC16 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
APOBEC3GQ9HC16 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
APOBEC3GQ9HC16 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
APOBEC3GQ9HC16 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
APOBEC3GQ9HC16 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
APOBEC3GQ9HC16 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
APOBEC3GQ9HC16 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
APOBEC3GQ9HC16 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
APOBEC3GQ9HC16 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
APOBEC3GQ9HC16 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
APOBEC3GQ9HC16 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
APOBEC3GQ9HC16 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
APOBEC3GQ9HC16 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
APOBEC3GQ9HC16 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
APOBEC3GQ9HC16 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
APOBEC3GQ9HC16 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
APOBEC3GQ9HC16 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
APOBEC3GQ9HC16 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
APOBEC3GQ9HC16 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
APOBEC3GQ9HC16 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOBEC3GQ9HC16 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOBEC3GQ9HC16 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOBEC3GQ9HC16 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOBEC3GQ9HC16 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
APOBEC3GQ9HC16 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOBEC3GQ9HC16 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
APOBEC3GQ9HC16 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
APOBEC3GQ9HC16 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
APOBEC3GQ9HC16 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
APOBEC3GQ9HC16 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
APOBEC3GQ9HC16 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
APOBEC3GQ9HC16 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
APOBEC3GQ9HC16 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
APOBEC3GQ9HC16 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
APOBEC3GQ9HC16 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
APOBEC3GQ9HC16 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
APOBEC3GQ9HC16 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
APOBEC3GQ9HC16 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
APOBEC3GQ9HC16 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
APOBEC3GQ9HC16 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
APOBEC3GQ9HC16 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
APOBEC3GQ9HC16 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
APOBEC3GQ9HC16 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
APOBEC3GQ9HC16 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
APOBEC3GQ9HC16 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
APOBEC3GQ9HC16 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
APOBEC3GQ9HC16 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
APOBEC3GQ9HC16 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
APOBEC3GQ9HC16 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
APOBEC3GQ9HC16 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
APOBEC3GQ9HC16 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
APOBEC3GQ9HC16 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
APOBEC3GQ9HC16 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
APOBEC3GQ9HC16 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
APOBEC3GQ9HC16 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
APOBEC3GQ9HC16 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
APOBEC3GQ9HC16 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
APOBEC3GQ9HC16 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
APOBEC3GQ9HC16 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
APOBEC3GQ9HC16 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOBEC3GQ9HC16 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOBEC3GQ9HC16 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOBEC3GQ9HC16 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
APOBEC3GQ9HC16 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
APOBEC3GQ9HC16 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOBEC3GQ9HC16 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOBEC3GQ9HC16 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOBEC3GQ9HC16 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOBEC3GQ9HC16 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOBEC3GQ9HC16 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
APOBEC3GQ9HC16 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
APOBEC3GQ9HC16 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
APOBEC3GQ9HC16 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
APOBEC3GQ9HC16 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
APOBEC3GQ9HC16 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
APOBEC3GQ9HC16 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
APOBEC3GQ9HC16 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
APOBEC3GQ9HC16 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOBEC3GQ9HC16 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOBEC3GQ9HC16 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOBEC3GQ9HC16 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOBEC3GQ9HC16 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOBEC3GQ9HC16 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOBEC3GQ9HC16 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOBEC3GQ9HC16 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOBEC3GQ9HC16 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
APOBEC3GQ9HC16 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
APOBEC3GQ9HC16 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
APOBEC3GQ9HC16 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms