Protein–RNA interactions for Protein: Q9H816

DCLRE1B, 5' exonuclease Apollo, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1BQ9H816 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCLRE1BQ9H816 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCLRE1BQ9H816 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCLRE1BQ9H816 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCLRE1BQ9H816 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCLRE1BQ9H816 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCLRE1BQ9H816 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCLRE1BQ9H816 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCLRE1BQ9H816 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCLRE1BQ9H816 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCLRE1BQ9H816 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCLRE1BQ9H816 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCLRE1BQ9H816 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCLRE1BQ9H816 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCLRE1BQ9H816 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCLRE1BQ9H816 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCLRE1BQ9H816 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCLRE1BQ9H816 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCLRE1BQ9H816 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCLRE1BQ9H816 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCLRE1BQ9H816 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCLRE1BQ9H816 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCLRE1BQ9H816 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCLRE1BQ9H816 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCLRE1BQ9H816 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCLRE1BQ9H816 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCLRE1BQ9H816 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCLRE1BQ9H816 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCLRE1BQ9H816 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCLRE1BQ9H816 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
DCLRE1BQ9H816 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
DCLRE1BQ9H816 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCLRE1BQ9H816 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCLRE1BQ9H816 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCLRE1BQ9H816 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCLRE1BQ9H816 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCLRE1BQ9H816 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCLRE1BQ9H816 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCLRE1BQ9H816 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCLRE1BQ9H816 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCLRE1BQ9H816 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCLRE1BQ9H816 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCLRE1BQ9H816 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCLRE1BQ9H816 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCLRE1BQ9H816 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCLRE1BQ9H816 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCLRE1BQ9H816 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DCLRE1BQ9H816 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCLRE1BQ9H816 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCLRE1BQ9H816 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCLRE1BQ9H816 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCLRE1BQ9H816 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DCLRE1BQ9H816 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DCLRE1BQ9H816 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCLRE1BQ9H816 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCLRE1BQ9H816 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCLRE1BQ9H816 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCLRE1BQ9H816 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCLRE1BQ9H816 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCLRE1BQ9H816 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCLRE1BQ9H816 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCLRE1BQ9H816 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCLRE1BQ9H816 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCLRE1BQ9H816 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCLRE1BQ9H816 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCLRE1BQ9H816 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCLRE1BQ9H816 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCLRE1BQ9H816 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCLRE1BQ9H816 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCLRE1BQ9H816 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCLRE1BQ9H816 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCLRE1BQ9H816 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCLRE1BQ9H816 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCLRE1BQ9H816 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCLRE1BQ9H816 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCLRE1BQ9H816 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCLRE1BQ9H816 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCLRE1BQ9H816 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCLRE1BQ9H816 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCLRE1BQ9H816 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DCLRE1BQ9H816 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCLRE1BQ9H816 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCLRE1BQ9H816 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCLRE1BQ9H816 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCLRE1BQ9H816 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCLRE1BQ9H816 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCLRE1BQ9H816 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCLRE1BQ9H816 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCLRE1BQ9H816 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCLRE1BQ9H816 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCLRE1BQ9H816 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCLRE1BQ9H816 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCLRE1BQ9H816 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DCLRE1BQ9H816 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCLRE1BQ9H816 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCLRE1BQ9H816 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCLRE1BQ9H816 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCLRE1BQ9H816 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCLRE1BQ9H816 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCLRE1BQ9H816 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms