Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1B4

NXF5, Nuclear RNA export factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF5Q9H1B4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NXF5Q9H1B4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NXF5Q9H1B4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NXF5Q9H1B4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NXF5Q9H1B4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXF5Q9H1B4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXF5Q9H1B4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXF5Q9H1B4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXF5Q9H1B4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NXF5Q9H1B4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXF5Q9H1B4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXF5Q9H1B4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXF5Q9H1B4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXF5Q9H1B4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXF5Q9H1B4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXF5Q9H1B4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXF5Q9H1B4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXF5Q9H1B4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXF5Q9H1B4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXF5Q9H1B4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXF5Q9H1B4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXF5Q9H1B4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXF5Q9H1B4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXF5Q9H1B4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NXF5Q9H1B4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NXF5Q9H1B4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NXF5Q9H1B4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NXF5Q9H1B4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NXF5Q9H1B4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NXF5Q9H1B4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NXF5Q9H1B4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NXF5Q9H1B4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NXF5Q9H1B4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NXF5Q9H1B4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NXF5Q9H1B4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NXF5Q9H1B4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NXF5Q9H1B4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NXF5Q9H1B4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NXF5Q9H1B4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NXF5Q9H1B4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NXF5Q9H1B4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NXF5Q9H1B4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NXF5Q9H1B4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NXF5Q9H1B4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NXF5Q9H1B4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NXF5Q9H1B4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NXF5Q9H1B4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NXF5Q9H1B4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NXF5Q9H1B4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NXF5Q9H1B4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NXF5Q9H1B4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NXF5Q9H1B4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXF5Q9H1B4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXF5Q9H1B4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXF5Q9H1B4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXF5Q9H1B4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXF5Q9H1B4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXF5Q9H1B4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXF5Q9H1B4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXF5Q9H1B4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NXF5Q9H1B4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NXF5Q9H1B4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NXF5Q9H1B4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NXF5Q9H1B4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NXF5Q9H1B4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NXF5Q9H1B4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NXF5Q9H1B4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NXF5Q9H1B4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NXF5Q9H1B4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NXF5Q9H1B4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NXF5Q9H1B4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NXF5Q9H1B4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NXF5Q9H1B4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NXF5Q9H1B4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NXF5Q9H1B4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NXF5Q9H1B4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NXF5Q9H1B4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NXF5Q9H1B4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXF5Q9H1B4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXF5Q9H1B4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXF5Q9H1B4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXF5Q9H1B4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXF5Q9H1B4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXF5Q9H1B4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXF5Q9H1B4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NXF5Q9H1B4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXF5Q9H1B4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXF5Q9H1B4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXF5Q9H1B4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXF5Q9H1B4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NXF5Q9H1B4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NXF5Q9H1B4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NXF5Q9H1B4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NXF5Q9H1B4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NXF5Q9H1B4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NXF5Q9H1B4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NXF5Q9H1B4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NXF5Q9H1B4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NXF5Q9H1B4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NXF5Q9H1B4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms