Protein–RNA interactions for Protein: Q9H175

CSRNP2, Cysteine/serine-rich nuclear protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP2Q9H175 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CSRNP2Q9H175 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CSRNP2Q9H175 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CSRNP2Q9H175 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CSRNP2Q9H175 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CSRNP2Q9H175 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CSRNP2Q9H175 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CSRNP2Q9H175 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CSRNP2Q9H175 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CSRNP2Q9H175 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CSRNP2Q9H175 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CSRNP2Q9H175 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CSRNP2Q9H175 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CSRNP2Q9H175 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CSRNP2Q9H175 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CSRNP2Q9H175 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CSRNP2Q9H175 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CSRNP2Q9H175 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CSRNP2Q9H175 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CSRNP2Q9H175 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CSRNP2Q9H175 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CSRNP2Q9H175 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CSRNP2Q9H175 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CSRNP2Q9H175 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CSRNP2Q9H175 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CSRNP2Q9H175 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CSRNP2Q9H175 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CSRNP2Q9H175 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CSRNP2Q9H175 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CSRNP2Q9H175 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CSRNP2Q9H175 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CSRNP2Q9H175 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CSRNP2Q9H175 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CSRNP2Q9H175 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CSRNP2Q9H175 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CSRNP2Q9H175 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CSRNP2Q9H175 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CSRNP2Q9H175 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CSRNP2Q9H175 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSRNP2Q9H175 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSRNP2Q9H175 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSRNP2Q9H175 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSRNP2Q9H175 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CSRNP2Q9H175 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSRNP2Q9H175 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSRNP2Q9H175 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSRNP2Q9H175 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSRNP2Q9H175 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSRNP2Q9H175 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSRNP2Q9H175 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CSRNP2Q9H175 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSRNP2Q9H175 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSRNP2Q9H175 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CSRNP2Q9H175 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CSRNP2Q9H175 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CSRNP2Q9H175 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CSRNP2Q9H175 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CSRNP2Q9H175 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CSRNP2Q9H175 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CSRNP2Q9H175 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CSRNP2Q9H175 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CSRNP2Q9H175 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CSRNP2Q9H175 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CSRNP2Q9H175 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CSRNP2Q9H175 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CSRNP2Q9H175 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CSRNP2Q9H175 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CSRNP2Q9H175 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CSRNP2Q9H175 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CSRNP2Q9H175 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CSRNP2Q9H175 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CSRNP2Q9H175 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CSRNP2Q9H175 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CSRNP2Q9H175 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CSRNP2Q9H175 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CSRNP2Q9H175 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CSRNP2Q9H175 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CSRNP2Q9H175 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CSRNP2Q9H175 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CSRNP2Q9H175 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CSRNP2Q9H175 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CSRNP2Q9H175 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CSRNP2Q9H175 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CSRNP2Q9H175 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CSRNP2Q9H175 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CSRNP2Q9H175 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CSRNP2Q9H175 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CSRNP2Q9H175 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CSRNP2Q9H175 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CSRNP2Q9H175 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CSRNP2Q9H175 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CSRNP2Q9H175 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CSRNP2Q9H175 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CSRNP2Q9H175 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CSRNP2Q9H175 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CSRNP2Q9H175 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CSRNP2Q9H175 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CSRNP2Q9H175 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CSRNP2Q9H175 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CSRNP2Q9H175 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms