Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU1

MCOLN1, Mucolipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN1Q9GZU1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MCOLN1Q9GZU1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
MCOLN1Q9GZU1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.56■■■□□ 2
MCOLN1Q9GZU1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MCOLN1Q9GZU1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
MCOLN1Q9GZU1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MCOLN1Q9GZU1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MCOLN1Q9GZU1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MCOLN1Q9GZU1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MCOLN1Q9GZU1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.53■■■□□ 2
MCOLN1Q9GZU1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.53■■■□□ 2
MCOLN1Q9GZU1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MCOLN1Q9GZU1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MCOLN1Q9GZU1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MCOLN1Q9GZU1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.52■■■□□ 2
MCOLN1Q9GZU1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MCOLN1Q9GZU1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
MCOLN1Q9GZU1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MCOLN1Q9GZU1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MCOLN1Q9GZU1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MCOLN1Q9GZU1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MCOLN1Q9GZU1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MCOLN1Q9GZU1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MCOLN1Q9GZU1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MCOLN1Q9GZU1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MCOLN1Q9GZU1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MCOLN1Q9GZU1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MCOLN1Q9GZU1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MCOLN1Q9GZU1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
MCOLN1Q9GZU1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
MCOLN1Q9GZU1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MCOLN1Q9GZU1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MCOLN1Q9GZU1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MCOLN1Q9GZU1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MCOLN1Q9GZU1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MCOLN1Q9GZU1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MCOLN1Q9GZU1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MCOLN1Q9GZU1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MCOLN1Q9GZU1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MCOLN1Q9GZU1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
MCOLN1Q9GZU1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MCOLN1Q9GZU1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MCOLN1Q9GZU1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
MCOLN1Q9GZU1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MCOLN1Q9GZU1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MCOLN1Q9GZU1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MCOLN1Q9GZU1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MCOLN1Q9GZU1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MCOLN1Q9GZU1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
MCOLN1Q9GZU1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MCOLN1Q9GZU1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MCOLN1Q9GZU1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MCOLN1Q9GZU1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MCOLN1Q9GZU1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MCOLN1Q9GZU1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MCOLN1Q9GZU1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MCOLN1Q9GZU1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MCOLN1Q9GZU1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MCOLN1Q9GZU1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MCOLN1Q9GZU1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MCOLN1Q9GZU1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MCOLN1Q9GZU1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MCOLN1Q9GZU1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MCOLN1Q9GZU1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MCOLN1Q9GZU1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
MCOLN1Q9GZU1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
MCOLN1Q9GZU1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MCOLN1Q9GZU1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MCOLN1Q9GZU1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MCOLN1Q9GZU1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MCOLN1Q9GZU1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MCOLN1Q9GZU1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MCOLN1Q9GZU1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MCOLN1Q9GZU1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MCOLN1Q9GZU1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MCOLN1Q9GZU1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
MCOLN1Q9GZU1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MCOLN1Q9GZU1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
MCOLN1Q9GZU1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MCOLN1Q9GZU1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MCOLN1Q9GZU1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MCOLN1Q9GZU1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MCOLN1Q9GZU1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MCOLN1Q9GZU1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MCOLN1Q9GZU1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MCOLN1Q9GZU1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MCOLN1Q9GZU1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MCOLN1Q9GZU1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MCOLN1Q9GZU1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MCOLN1Q9GZU1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MCOLN1Q9GZU1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MCOLN1Q9GZU1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MCOLN1Q9GZU1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MCOLN1Q9GZU1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MCOLN1Q9GZU1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MCOLN1Q9GZU1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MCOLN1Q9GZU1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MCOLN1Q9GZU1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MCOLN1Q9GZU1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MCOLN1Q9GZU1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms