Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMIM3Q9BZL3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMIM3Q9BZL3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SMIM3Q9BZL3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMIM3Q9BZL3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMIM3Q9BZL3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMIM3Q9BZL3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SMIM3Q9BZL3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMIM3Q9BZL3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMIM3Q9BZL3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMIM3Q9BZL3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMIM3Q9BZL3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SMIM3Q9BZL3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMIM3Q9BZL3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMIM3Q9BZL3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMIM3Q9BZL3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMIM3Q9BZL3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMIM3Q9BZL3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMIM3Q9BZL3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMIM3Q9BZL3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMIM3Q9BZL3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMIM3Q9BZL3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMIM3Q9BZL3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMIM3Q9BZL3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMIM3Q9BZL3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMIM3Q9BZL3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMIM3Q9BZL3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMIM3Q9BZL3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMIM3Q9BZL3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMIM3Q9BZL3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMIM3Q9BZL3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMIM3Q9BZL3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMIM3Q9BZL3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMIM3Q9BZL3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMIM3Q9BZL3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMIM3Q9BZL3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMIM3Q9BZL3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMIM3Q9BZL3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMIM3Q9BZL3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SMIM3Q9BZL3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMIM3Q9BZL3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMIM3Q9BZL3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMIM3Q9BZL3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM3Q9BZL3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM3Q9BZL3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM3Q9BZL3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM3Q9BZL3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM3Q9BZL3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM3Q9BZL3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM3Q9BZL3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM3Q9BZL3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM3Q9BZL3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM3Q9BZL3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM3Q9BZL3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMIM3Q9BZL3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMIM3Q9BZL3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMIM3Q9BZL3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMIM3Q9BZL3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms