Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSBP4Q9BWG4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSBP4Q9BWG4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSBP4Q9BWG4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSBP4Q9BWG4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SSBP4Q9BWG4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SSBP4Q9BWG4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SSBP4Q9BWG4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SSBP4Q9BWG4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SSBP4Q9BWG4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSBP4Q9BWG4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSBP4Q9BWG4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSBP4Q9BWG4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSBP4Q9BWG4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSBP4Q9BWG4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSBP4Q9BWG4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSBP4Q9BWG4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSBP4Q9BWG4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSBP4Q9BWG4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSBP4Q9BWG4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSBP4Q9BWG4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSBP4Q9BWG4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSBP4Q9BWG4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSBP4Q9BWG4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSBP4Q9BWG4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSBP4Q9BWG4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSBP4Q9BWG4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSBP4Q9BWG4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSBP4Q9BWG4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSBP4Q9BWG4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSBP4Q9BWG4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSBP4Q9BWG4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSBP4Q9BWG4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSBP4Q9BWG4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSBP4Q9BWG4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSBP4Q9BWG4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSBP4Q9BWG4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSBP4Q9BWG4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSBP4Q9BWG4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSBP4Q9BWG4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSBP4Q9BWG4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSBP4Q9BWG4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSBP4Q9BWG4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSBP4Q9BWG4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSBP4Q9BWG4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSBP4Q9BWG4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSBP4Q9BWG4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSBP4Q9BWG4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSBP4Q9BWG4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSBP4Q9BWG4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSBP4Q9BWG4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSBP4Q9BWG4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSBP4Q9BWG4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSBP4Q9BWG4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSBP4Q9BWG4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSBP4Q9BWG4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSBP4Q9BWG4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSBP4Q9BWG4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSBP4Q9BWG4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSBP4Q9BWG4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSBP4Q9BWG4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSBP4Q9BWG4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSBP4Q9BWG4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSBP4Q9BWG4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSBP4Q9BWG4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSBP4Q9BWG4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSBP4Q9BWG4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSBP4Q9BWG4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSBP4Q9BWG4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSBP4Q9BWG4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSBP4Q9BWG4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSBP4Q9BWG4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSBP4Q9BWG4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSBP4Q9BWG4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSBP4Q9BWG4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSBP4Q9BWG4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSBP4Q9BWG4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSBP4Q9BWG4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SSBP4Q9BWG4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSBP4Q9BWG4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SSBP4Q9BWG4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSBP4Q9BWG4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSBP4Q9BWG4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSBP4Q9BWG4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSBP4Q9BWG4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSBP4Q9BWG4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSBP4Q9BWG4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSBP4Q9BWG4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSBP4Q9BWG4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSBP4Q9BWG4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSBP4Q9BWG4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SSBP4Q9BWG4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSBP4Q9BWG4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSBP4Q9BWG4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSBP4Q9BWG4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SSBP4Q9BWG4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSBP4Q9BWG4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSBP4Q9BWG4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSBP4Q9BWG4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSBP4Q9BWG4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms