Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVM2

DPCD, Protein DPCD, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPCDQ9BVM2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DPCDQ9BVM2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DPCDQ9BVM2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DPCDQ9BVM2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DPCDQ9BVM2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DPCDQ9BVM2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DPCDQ9BVM2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DPCDQ9BVM2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DPCDQ9BVM2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DPCDQ9BVM2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DPCDQ9BVM2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DPCDQ9BVM2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DPCDQ9BVM2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DPCDQ9BVM2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DPCDQ9BVM2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DPCDQ9BVM2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DPCDQ9BVM2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DPCDQ9BVM2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DPCDQ9BVM2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
DPCDQ9BVM2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
DPCDQ9BVM2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DPCDQ9BVM2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DPCDQ9BVM2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DPCDQ9BVM2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DPCDQ9BVM2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DPCDQ9BVM2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DPCDQ9BVM2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DPCDQ9BVM2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DPCDQ9BVM2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DPCDQ9BVM2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DPCDQ9BVM2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DPCDQ9BVM2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DPCDQ9BVM2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DPCDQ9BVM2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DPCDQ9BVM2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DPCDQ9BVM2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DPCDQ9BVM2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DPCDQ9BVM2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DPCDQ9BVM2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DPCDQ9BVM2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DPCDQ9BVM2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DPCDQ9BVM2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DPCDQ9BVM2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DPCDQ9BVM2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DPCDQ9BVM2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DPCDQ9BVM2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DPCDQ9BVM2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
DPCDQ9BVM2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DPCDQ9BVM2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DPCDQ9BVM2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DPCDQ9BVM2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DPCDQ9BVM2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DPCDQ9BVM2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DPCDQ9BVM2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DPCDQ9BVM2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DPCDQ9BVM2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DPCDQ9BVM2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DPCDQ9BVM2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DPCDQ9BVM2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DPCDQ9BVM2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DPCDQ9BVM2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DPCDQ9BVM2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DPCDQ9BVM2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DPCDQ9BVM2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
DPCDQ9BVM2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DPCDQ9BVM2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DPCDQ9BVM2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DPCDQ9BVM2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DPCDQ9BVM2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DPCDQ9BVM2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DPCDQ9BVM2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DPCDQ9BVM2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DPCDQ9BVM2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
DPCDQ9BVM2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
DPCDQ9BVM2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
DPCDQ9BVM2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
DPCDQ9BVM2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
DPCDQ9BVM2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
DPCDQ9BVM2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DPCDQ9BVM2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DPCDQ9BVM2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DPCDQ9BVM2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DPCDQ9BVM2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DPCDQ9BVM2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DPCDQ9BVM2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DPCDQ9BVM2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DPCDQ9BVM2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
DPCDQ9BVM2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DPCDQ9BVM2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DPCDQ9BVM2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DPCDQ9BVM2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DPCDQ9BVM2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DPCDQ9BVM2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DPCDQ9BVM2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DPCDQ9BVM2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DPCDQ9BVM2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DPCDQ9BVM2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DPCDQ9BVM2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DPCDQ9BVM2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DPCDQ9BVM2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms