Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVK6

TMED9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED9Q9BVK6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMED9Q9BVK6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMED9Q9BVK6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMED9Q9BVK6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMED9Q9BVK6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMED9Q9BVK6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMED9Q9BVK6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMED9Q9BVK6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TMED9Q9BVK6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMED9Q9BVK6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMED9Q9BVK6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMED9Q9BVK6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMED9Q9BVK6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMED9Q9BVK6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMED9Q9BVK6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMED9Q9BVK6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMED9Q9BVK6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMED9Q9BVK6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMED9Q9BVK6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMED9Q9BVK6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMED9Q9BVK6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMED9Q9BVK6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMED9Q9BVK6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMED9Q9BVK6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMED9Q9BVK6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMED9Q9BVK6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMED9Q9BVK6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMED9Q9BVK6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMED9Q9BVK6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMED9Q9BVK6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMED9Q9BVK6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMED9Q9BVK6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TMED9Q9BVK6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMED9Q9BVK6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMED9Q9BVK6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMED9Q9BVK6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMED9Q9BVK6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMED9Q9BVK6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMED9Q9BVK6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMED9Q9BVK6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMED9Q9BVK6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMED9Q9BVK6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMED9Q9BVK6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMED9Q9BVK6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TMED9Q9BVK6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMED9Q9BVK6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMED9Q9BVK6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMED9Q9BVK6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMED9Q9BVK6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMED9Q9BVK6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMED9Q9BVK6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMED9Q9BVK6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMED9Q9BVK6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMED9Q9BVK6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMED9Q9BVK6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMED9Q9BVK6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMED9Q9BVK6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMED9Q9BVK6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMED9Q9BVK6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMED9Q9BVK6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TMED9Q9BVK6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMED9Q9BVK6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMED9Q9BVK6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMED9Q9BVK6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMED9Q9BVK6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TMED9Q9BVK6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMED9Q9BVK6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TMED9Q9BVK6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMED9Q9BVK6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TMED9Q9BVK6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMED9Q9BVK6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMED9Q9BVK6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMED9Q9BVK6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMED9Q9BVK6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMED9Q9BVK6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMED9Q9BVK6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMED9Q9BVK6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMED9Q9BVK6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMED9Q9BVK6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMED9Q9BVK6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMED9Q9BVK6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMED9Q9BVK6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMED9Q9BVK6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMED9Q9BVK6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMED9Q9BVK6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMED9Q9BVK6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMED9Q9BVK6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMED9Q9BVK6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMED9Q9BVK6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMED9Q9BVK6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMED9Q9BVK6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMED9Q9BVK6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMED9Q9BVK6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMED9Q9BVK6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMED9Q9BVK6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TMED9Q9BVK6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMED9Q9BVK6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMED9Q9BVK6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMED9Q9BVK6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMED9Q9BVK6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms