Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG2

SH2D3A, SH2 domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D3AQ9BRG2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SH2D3AQ9BRG2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SH2D3AQ9BRG2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SH2D3AQ9BRG2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SH2D3AQ9BRG2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SH2D3AQ9BRG2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SH2D3AQ9BRG2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SH2D3AQ9BRG2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SH2D3AQ9BRG2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SH2D3AQ9BRG2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SH2D3AQ9BRG2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SH2D3AQ9BRG2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SH2D3AQ9BRG2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SH2D3AQ9BRG2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SH2D3AQ9BRG2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SH2D3AQ9BRG2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SH2D3AQ9BRG2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SH2D3AQ9BRG2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SH2D3AQ9BRG2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SH2D3AQ9BRG2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SH2D3AQ9BRG2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SH2D3AQ9BRG2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SH2D3AQ9BRG2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SH2D3AQ9BRG2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SH2D3AQ9BRG2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SH2D3AQ9BRG2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SH2D3AQ9BRG2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SH2D3AQ9BRG2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SH2D3AQ9BRG2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SH2D3AQ9BRG2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SH2D3AQ9BRG2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SH2D3AQ9BRG2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SH2D3AQ9BRG2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SH2D3AQ9BRG2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SH2D3AQ9BRG2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SH2D3AQ9BRG2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SH2D3AQ9BRG2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SH2D3AQ9BRG2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SH2D3AQ9BRG2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SH2D3AQ9BRG2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SH2D3AQ9BRG2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SH2D3AQ9BRG2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SH2D3AQ9BRG2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SH2D3AQ9BRG2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SH2D3AQ9BRG2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SH2D3AQ9BRG2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SH2D3AQ9BRG2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SH2D3AQ9BRG2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SH2D3AQ9BRG2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SH2D3AQ9BRG2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SH2D3AQ9BRG2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SH2D3AQ9BRG2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SH2D3AQ9BRG2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SH2D3AQ9BRG2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SH2D3AQ9BRG2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SH2D3AQ9BRG2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SH2D3AQ9BRG2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SH2D3AQ9BRG2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SH2D3AQ9BRG2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SH2D3AQ9BRG2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SH2D3AQ9BRG2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SH2D3AQ9BRG2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SH2D3AQ9BRG2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SH2D3AQ9BRG2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SH2D3AQ9BRG2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SH2D3AQ9BRG2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SH2D3AQ9BRG2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SH2D3AQ9BRG2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SH2D3AQ9BRG2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SH2D3AQ9BRG2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SH2D3AQ9BRG2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SH2D3AQ9BRG2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SH2D3AQ9BRG2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SH2D3AQ9BRG2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SH2D3AQ9BRG2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SH2D3AQ9BRG2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SH2D3AQ9BRG2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SH2D3AQ9BRG2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SH2D3AQ9BRG2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SH2D3AQ9BRG2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SH2D3AQ9BRG2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SH2D3AQ9BRG2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SH2D3AQ9BRG2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SH2D3AQ9BRG2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SH2D3AQ9BRG2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SH2D3AQ9BRG2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SH2D3AQ9BRG2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SH2D3AQ9BRG2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SH2D3AQ9BRG2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SH2D3AQ9BRG2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SH2D3AQ9BRG2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SH2D3AQ9BRG2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SH2D3AQ9BRG2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SH2D3AQ9BRG2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SH2D3AQ9BRG2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SH2D3AQ9BRG2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SH2D3AQ9BRG2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SH2D3AQ9BRG2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SH2D3AQ9BRG2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SH2D3AQ9BRG2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms