Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG1

VPS25, Vacuolar protein-sorting-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS25Q9BRG1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VPS25Q9BRG1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VPS25Q9BRG1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VPS25Q9BRG1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VPS25Q9BRG1 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VPS25Q9BRG1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
VPS25Q9BRG1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VPS25Q9BRG1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
VPS25Q9BRG1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VPS25Q9BRG1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VPS25Q9BRG1 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VPS25Q9BRG1 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VPS25Q9BRG1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VPS25Q9BRG1 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VPS25Q9BRG1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VPS25Q9BRG1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VPS25Q9BRG1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VPS25Q9BRG1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VPS25Q9BRG1 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VPS25Q9BRG1 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VPS25Q9BRG1 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VPS25Q9BRG1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VPS25Q9BRG1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VPS25Q9BRG1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VPS25Q9BRG1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VPS25Q9BRG1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VPS25Q9BRG1 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VPS25Q9BRG1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VPS25Q9BRG1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VPS25Q9BRG1 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VPS25Q9BRG1 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VPS25Q9BRG1 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VPS25Q9BRG1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VPS25Q9BRG1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VPS25Q9BRG1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VPS25Q9BRG1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VPS25Q9BRG1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VPS25Q9BRG1 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VPS25Q9BRG1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VPS25Q9BRG1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPS25Q9BRG1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPS25Q9BRG1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPS25Q9BRG1 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPS25Q9BRG1 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPS25Q9BRG1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPS25Q9BRG1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPS25Q9BRG1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPS25Q9BRG1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPS25Q9BRG1 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPS25Q9BRG1 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPS25Q9BRG1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPS25Q9BRG1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS25Q9BRG1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS25Q9BRG1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS25Q9BRG1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS25Q9BRG1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS25Q9BRG1 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS25Q9BRG1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS25Q9BRG1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS25Q9BRG1 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS25Q9BRG1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS25Q9BRG1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS25Q9BRG1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS25Q9BRG1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPS25Q9BRG1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS25Q9BRG1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS25Q9BRG1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS25Q9BRG1 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS25Q9BRG1 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS25Q9BRG1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS25Q9BRG1 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS25Q9BRG1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS25Q9BRG1 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS25Q9BRG1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS25Q9BRG1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VPS25Q9BRG1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VPS25Q9BRG1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VPS25Q9BRG1 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VPS25Q9BRG1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VPS25Q9BRG1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VPS25Q9BRG1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VPS25Q9BRG1 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VPS25Q9BRG1 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VPS25Q9BRG1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VPS25Q9BRG1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VPS25Q9BRG1 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VPS25Q9BRG1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VPS25Q9BRG1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VPS25Q9BRG1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VPS25Q9BRG1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VPS25Q9BRG1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VPS25Q9BRG1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VPS25Q9BRG1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VPS25Q9BRG1 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VPS25Q9BRG1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VPS25Q9BRG1 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VPS25Q9BRG1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
VPS25Q9BRG1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VPS25Q9BRG1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VPS25Q9BRG1 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms