Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK4

BBS4, Bardet-Biedl syndrome 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS4Q96RK4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BBS4Q96RK4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BBS4Q96RK4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BBS4Q96RK4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BBS4Q96RK4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BBS4Q96RK4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BBS4Q96RK4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BBS4Q96RK4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BBS4Q96RK4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BBS4Q96RK4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BBS4Q96RK4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BBS4Q96RK4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
BBS4Q96RK4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BBS4Q96RK4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BBS4Q96RK4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BBS4Q96RK4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BBS4Q96RK4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
BBS4Q96RK4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
BBS4Q96RK4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BBS4Q96RK4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BBS4Q96RK4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BBS4Q96RK4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BBS4Q96RK4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BBS4Q96RK4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BBS4Q96RK4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BBS4Q96RK4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BBS4Q96RK4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BBS4Q96RK4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
BBS4Q96RK4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BBS4Q96RK4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BBS4Q96RK4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BBS4Q96RK4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BBS4Q96RK4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BBS4Q96RK4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BBS4Q96RK4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BBS4Q96RK4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BBS4Q96RK4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BBS4Q96RK4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BBS4Q96RK4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BBS4Q96RK4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BBS4Q96RK4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BBS4Q96RK4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BBS4Q96RK4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BBS4Q96RK4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BBS4Q96RK4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BBS4Q96RK4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BBS4Q96RK4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBS4Q96RK4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBS4Q96RK4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BBS4Q96RK4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBS4Q96RK4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBS4Q96RK4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBS4Q96RK4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BBS4Q96RK4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BBS4Q96RK4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BBS4Q96RK4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BBS4Q96RK4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BBS4Q96RK4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BBS4Q96RK4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BBS4Q96RK4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BBS4Q96RK4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BBS4Q96RK4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BBS4Q96RK4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BBS4Q96RK4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBS4Q96RK4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBS4Q96RK4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBS4Q96RK4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BBS4Q96RK4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBS4Q96RK4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBS4Q96RK4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBS4Q96RK4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBS4Q96RK4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBS4Q96RK4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BBS4Q96RK4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BBS4Q96RK4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BBS4Q96RK4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BBS4Q96RK4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BBS4Q96RK4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BBS4Q96RK4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BBS4Q96RK4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BBS4Q96RK4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BBS4Q96RK4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BBS4Q96RK4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BBS4Q96RK4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBS4Q96RK4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBS4Q96RK4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBS4Q96RK4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBS4Q96RK4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBS4Q96RK4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBS4Q96RK4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBS4Q96RK4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBS4Q96RK4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBS4Q96RK4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBS4Q96RK4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BBS4Q96RK4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BBS4Q96RK4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BBS4Q96RK4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BBS4Q96RK4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BBS4Q96RK4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BBS4Q96RK4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms