Protein–RNA interactions for Protein: Q96MI6

PPM1M, Protein phosphatase 1M, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1MQ96MI6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPM1MQ96MI6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPM1MQ96MI6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPM1MQ96MI6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPM1MQ96MI6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPM1MQ96MI6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPM1MQ96MI6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPM1MQ96MI6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1MQ96MI6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1MQ96MI6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1MQ96MI6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1MQ96MI6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1MQ96MI6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1MQ96MI6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1MQ96MI6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1MQ96MI6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1MQ96MI6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1MQ96MI6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1MQ96MI6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1MQ96MI6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1MQ96MI6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1MQ96MI6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPM1MQ96MI6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPM1MQ96MI6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPM1MQ96MI6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPM1MQ96MI6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPM1MQ96MI6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPM1MQ96MI6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPM1MQ96MI6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPM1MQ96MI6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPM1MQ96MI6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPM1MQ96MI6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPM1MQ96MI6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPM1MQ96MI6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPM1MQ96MI6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPM1MQ96MI6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPM1MQ96MI6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPM1MQ96MI6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPM1MQ96MI6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPM1MQ96MI6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPM1MQ96MI6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPM1MQ96MI6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPM1MQ96MI6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PPM1MQ96MI6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPM1MQ96MI6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPM1MQ96MI6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPM1MQ96MI6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPM1MQ96MI6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPM1MQ96MI6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPM1MQ96MI6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPM1MQ96MI6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPM1MQ96MI6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPM1MQ96MI6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPM1MQ96MI6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPM1MQ96MI6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPM1MQ96MI6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPM1MQ96MI6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPM1MQ96MI6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPM1MQ96MI6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPM1MQ96MI6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPM1MQ96MI6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PPM1MQ96MI6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPM1MQ96MI6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPM1MQ96MI6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPM1MQ96MI6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPM1MQ96MI6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPM1MQ96MI6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPM1MQ96MI6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPM1MQ96MI6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPM1MQ96MI6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPM1MQ96MI6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPM1MQ96MI6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPM1MQ96MI6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPM1MQ96MI6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPM1MQ96MI6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPM1MQ96MI6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPM1MQ96MI6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPM1MQ96MI6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPM1MQ96MI6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPM1MQ96MI6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPM1MQ96MI6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPM1MQ96MI6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPM1MQ96MI6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPM1MQ96MI6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPM1MQ96MI6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PPM1MQ96MI6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPM1MQ96MI6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPM1MQ96MI6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPM1MQ96MI6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPM1MQ96MI6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPM1MQ96MI6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPM1MQ96MI6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PPM1MQ96MI6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPM1MQ96MI6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPM1MQ96MI6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPM1MQ96MI6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PPM1MQ96MI6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPM1MQ96MI6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPM1MQ96MI6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPM1MQ96MI6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms