Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC114Q96M63 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC114Q96M63 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC114Q96M63 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC114Q96M63 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC114Q96M63 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC114Q96M63 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC114Q96M63 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC114Q96M63 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC114Q96M63 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC114Q96M63 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC114Q96M63 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC114Q96M63 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC114Q96M63 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC114Q96M63 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC114Q96M63 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC114Q96M63 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC114Q96M63 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC114Q96M63 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC114Q96M63 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC114Q96M63 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC114Q96M63 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC114Q96M63 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC114Q96M63 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC114Q96M63 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC114Q96M63 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC114Q96M63 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC114Q96M63 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC114Q96M63 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC114Q96M63 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC114Q96M63 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC114Q96M63 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC114Q96M63 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC114Q96M63 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC114Q96M63 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC114Q96M63 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC114Q96M63 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC114Q96M63 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC114Q96M63 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC114Q96M63 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC114Q96M63 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC114Q96M63 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC114Q96M63 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC114Q96M63 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC114Q96M63 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC114Q96M63 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC114Q96M63 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC114Q96M63 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC114Q96M63 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC114Q96M63 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC114Q96M63 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC114Q96M63 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC114Q96M63 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC114Q96M63 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC114Q96M63 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC114Q96M63 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC114Q96M63 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC114Q96M63 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC114Q96M63 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC114Q96M63 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC114Q96M63 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC114Q96M63 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC114Q96M63 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC114Q96M63 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC114Q96M63 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC114Q96M63 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC114Q96M63 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC114Q96M63 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC114Q96M63 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC114Q96M63 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC114Q96M63 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC114Q96M63 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC114Q96M63 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC114Q96M63 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC114Q96M63 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC114Q96M63 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC114Q96M63 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC114Q96M63 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC114Q96M63 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC114Q96M63 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC114Q96M63 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC114Q96M63 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC114Q96M63 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC114Q96M63 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC114Q96M63 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC114Q96M63 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC114Q96M63 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCDC114Q96M63 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC114Q96M63 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC114Q96M63 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC114Q96M63 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC114Q96M63 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC114Q96M63 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC114Q96M63 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC114Q96M63 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC114Q96M63 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC114Q96M63 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC114Q96M63 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC114Q96M63 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC114Q96M63 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms