Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDLIM2Q96JY6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDLIM2Q96JY6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDLIM2Q96JY6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDLIM2Q96JY6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDLIM2Q96JY6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDLIM2Q96JY6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDLIM2Q96JY6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDLIM2Q96JY6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDLIM2Q96JY6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDLIM2Q96JY6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PDLIM2Q96JY6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDLIM2Q96JY6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDLIM2Q96JY6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDLIM2Q96JY6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDLIM2Q96JY6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PDLIM2Q96JY6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDLIM2Q96JY6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDLIM2Q96JY6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDLIM2Q96JY6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDLIM2Q96JY6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDLIM2Q96JY6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PDLIM2Q96JY6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDLIM2Q96JY6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDLIM2Q96JY6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDLIM2Q96JY6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDLIM2Q96JY6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDLIM2Q96JY6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDLIM2Q96JY6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PDLIM2Q96JY6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDLIM2Q96JY6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
PDLIM2Q96JY6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDLIM2Q96JY6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PDLIM2Q96JY6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDLIM2Q96JY6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDLIM2Q96JY6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDLIM2Q96JY6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDLIM2Q96JY6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDLIM2Q96JY6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDLIM2Q96JY6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDLIM2Q96JY6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDLIM2Q96JY6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDLIM2Q96JY6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDLIM2Q96JY6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDLIM2Q96JY6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDLIM2Q96JY6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDLIM2Q96JY6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDLIM2Q96JY6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PDLIM2Q96JY6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDLIM2Q96JY6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDLIM2Q96JY6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDLIM2Q96JY6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDLIM2Q96JY6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDLIM2Q96JY6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDLIM2Q96JY6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDLIM2Q96JY6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDLIM2Q96JY6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDLIM2Q96JY6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDLIM2Q96JY6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDLIM2Q96JY6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDLIM2Q96JY6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDLIM2Q96JY6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDLIM2Q96JY6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDLIM2Q96JY6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDLIM2Q96JY6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDLIM2Q96JY6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
PDLIM2Q96JY6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PDLIM2Q96JY6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDLIM2Q96JY6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDLIM2Q96JY6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDLIM2Q96JY6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDLIM2Q96JY6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDLIM2Q96JY6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDLIM2Q96JY6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDLIM2Q96JY6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDLIM2Q96JY6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDLIM2Q96JY6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDLIM2Q96JY6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDLIM2Q96JY6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDLIM2Q96JY6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDLIM2Q96JY6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDLIM2Q96JY6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDLIM2Q96JY6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDLIM2Q96JY6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDLIM2Q96JY6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDLIM2Q96JY6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDLIM2Q96JY6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDLIM2Q96JY6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDLIM2Q96JY6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDLIM2Q96JY6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDLIM2Q96JY6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDLIM2Q96JY6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDLIM2Q96JY6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDLIM2Q96JY6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDLIM2Q96JY6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDLIM2Q96JY6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDLIM2Q96JY6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDLIM2Q96JY6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDLIM2Q96JY6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDLIM2Q96JY6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.3 ms