Protein–RNA interactions for Protein: Q96JX3

SERAC1, Protein SERAC1, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERAC1Q96JX3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SERAC1Q96JX3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SERAC1Q96JX3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SERAC1Q96JX3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SERAC1Q96JX3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SERAC1Q96JX3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SERAC1Q96JX3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SERAC1Q96JX3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SERAC1Q96JX3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SERAC1Q96JX3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SERAC1Q96JX3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SERAC1Q96JX3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SERAC1Q96JX3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SERAC1Q96JX3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SERAC1Q96JX3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SERAC1Q96JX3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SERAC1Q96JX3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SERAC1Q96JX3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SERAC1Q96JX3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SERAC1Q96JX3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SERAC1Q96JX3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SERAC1Q96JX3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SERAC1Q96JX3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SERAC1Q96JX3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SERAC1Q96JX3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SERAC1Q96JX3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SERAC1Q96JX3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SERAC1Q96JX3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SERAC1Q96JX3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SERAC1Q96JX3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SERAC1Q96JX3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SERAC1Q96JX3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SERAC1Q96JX3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SERAC1Q96JX3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SERAC1Q96JX3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SERAC1Q96JX3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SERAC1Q96JX3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SERAC1Q96JX3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SERAC1Q96JX3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SERAC1Q96JX3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SERAC1Q96JX3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SERAC1Q96JX3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SERAC1Q96JX3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SERAC1Q96JX3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SERAC1Q96JX3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SERAC1Q96JX3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SERAC1Q96JX3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SERAC1Q96JX3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SERAC1Q96JX3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SERAC1Q96JX3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SERAC1Q96JX3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SERAC1Q96JX3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SERAC1Q96JX3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SERAC1Q96JX3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SERAC1Q96JX3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SERAC1Q96JX3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SERAC1Q96JX3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SERAC1Q96JX3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SERAC1Q96JX3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SERAC1Q96JX3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SERAC1Q96JX3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SERAC1Q96JX3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SERAC1Q96JX3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SERAC1Q96JX3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SERAC1Q96JX3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SERAC1Q96JX3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SERAC1Q96JX3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SERAC1Q96JX3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SERAC1Q96JX3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SERAC1Q96JX3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
SERAC1Q96JX3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SERAC1Q96JX3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SERAC1Q96JX3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SERAC1Q96JX3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SERAC1Q96JX3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SERAC1Q96JX3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SERAC1Q96JX3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SERAC1Q96JX3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SERAC1Q96JX3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SERAC1Q96JX3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SERAC1Q96JX3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SERAC1Q96JX3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SERAC1Q96JX3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SERAC1Q96JX3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SERAC1Q96JX3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SERAC1Q96JX3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SERAC1Q96JX3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SERAC1Q96JX3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SERAC1Q96JX3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SERAC1Q96JX3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SERAC1Q96JX3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SERAC1Q96JX3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SERAC1Q96JX3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SERAC1Q96JX3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SERAC1Q96JX3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SERAC1Q96JX3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SERAC1Q96JX3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SERAC1Q96JX3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SERAC1Q96JX3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SERAC1Q96JX3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.3 ms