Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PGBD1Q96JS3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PGBD1Q96JS3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PGBD1Q96JS3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PGBD1Q96JS3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PGBD1Q96JS3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PGBD1Q96JS3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PGBD1Q96JS3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PGBD1Q96JS3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PGBD1Q96JS3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PGBD1Q96JS3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PGBD1Q96JS3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PGBD1Q96JS3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PGBD1Q96JS3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PGBD1Q96JS3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PGBD1Q96JS3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PGBD1Q96JS3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PGBD1Q96JS3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PGBD1Q96JS3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PGBD1Q96JS3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PGBD1Q96JS3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PGBD1Q96JS3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PGBD1Q96JS3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PGBD1Q96JS3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PGBD1Q96JS3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PGBD1Q96JS3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PGBD1Q96JS3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PGBD1Q96JS3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PGBD1Q96JS3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PGBD1Q96JS3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PGBD1Q96JS3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PGBD1Q96JS3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PGBD1Q96JS3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PGBD1Q96JS3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PGBD1Q96JS3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PGBD1Q96JS3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PGBD1Q96JS3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PGBD1Q96JS3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PGBD1Q96JS3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PGBD1Q96JS3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PGBD1Q96JS3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PGBD1Q96JS3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PGBD1Q96JS3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PGBD1Q96JS3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PGBD1Q96JS3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PGBD1Q96JS3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PGBD1Q96JS3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PGBD1Q96JS3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PGBD1Q96JS3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PGBD1Q96JS3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PGBD1Q96JS3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PGBD1Q96JS3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PGBD1Q96JS3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PGBD1Q96JS3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PGBD1Q96JS3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PGBD1Q96JS3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PGBD1Q96JS3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PGBD1Q96JS3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PGBD1Q96JS3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PGBD1Q96JS3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PGBD1Q96JS3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PGBD1Q96JS3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PGBD1Q96JS3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PGBD1Q96JS3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PGBD1Q96JS3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PGBD1Q96JS3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PGBD1Q96JS3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PGBD1Q96JS3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PGBD1Q96JS3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PGBD1Q96JS3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PGBD1Q96JS3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PGBD1Q96JS3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PGBD1Q96JS3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PGBD1Q96JS3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PGBD1Q96JS3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PGBD1Q96JS3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PGBD1Q96JS3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PGBD1Q96JS3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PGBD1Q96JS3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PGBD1Q96JS3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PGBD1Q96JS3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PGBD1Q96JS3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PGBD1Q96JS3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PGBD1Q96JS3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PGBD1Q96JS3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PGBD1Q96JS3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PGBD1Q96JS3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PGBD1Q96JS3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PGBD1Q96JS3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PGBD1Q96JS3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PGBD1Q96JS3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PGBD1Q96JS3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PGBD1Q96JS3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PGBD1Q96JS3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PGBD1Q96JS3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PGBD1Q96JS3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PGBD1Q96JS3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PGBD1Q96JS3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PGBD1Q96JS3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PGBD1Q96JS3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms